微生物种群鉴定测序(16S/18S/ITS)

微生物种群鉴定测序(16S/18S/ITS)为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，对18SrDNA某个高变区进行测序，用于研究环境微生物中真核微生物的群落多样性。ITS测序：ITS分为两个区域ITS1h和ITS2，ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于真核生物rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1或ITS2进行测序，用于研究环境微生物中真菌群落结构多样性。微生物种群鉴定测序（16S18SITS）方法是首先提取样品中微生物总DNA，然后运用PCR技术扩增细菌基因组中的16SrDNA、真菌基因组中的18SrDNA或ITS区域，获得绝大部分微生物16SrDNA、18SrDNA或ITS高可变区的扩增产物，并构建扩增产物的文库，利用第二代测序平台进行大规模高通量测序，然后比较分析测序数据，该方法最近几年已广泛应用于转基因作物对土壤微生物群落多样性影响的研究。