宏基因组SHOTGUN方法测序

宏基因组shotgun方法测序，是对特定环境样品中的微生物群体基因组（尤其是那些种类众多的难于培养的微生物），进行序列测定和功能基因的发掘，来分析微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体的多样性与丰度，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。宏基因组shotgun方法测序包括MetaPhlAn：群落组成分析；PICRUSt：基因组功能预测；PhyloPhlAn：构建系统发育树；GraPhlAn：可视化分类和系统发育信息。