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宏基因组shotgun方法测序的介绍
宏基因组shotgun方法测序,是对特定环境样品中的微生物群体基因组(尤其是那些种类众多的难于培养的微生物),进行序列测定和功能基因的发掘,来分析微生物群体基因组成及功能,解读微生物群体的多样性与丰度,发掘和研究新的、具有特定功能的基因。宏基因组shotgun方法测序包括MetaPhlAn:群落组成分析;PICRUSt:基因组功能预测;PhyloPhlAn:构建系统发育树;GraPhlAn:可视化分类和系统发育信息。
2020-01-01
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