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磺胺间甲氧嘧啶即磺胺-6-甲氧嘧啶，抗菌作用强，对球虫和弓形虫也有显著作用。内服易吸收，乙酰化率低，不易产生晶尿和血尿，用于治疗各种敏感菌感染及禽球虫病、猪弓形虫病等。其对链球菌、肺炎球菌、沙门杆菌、巴氏杆菌、化脓棒状杆菌、大肠杆菌作用最强，对葡萄球菌、变形杆菌、炭疽杆菌等亦有抗菌作用，因此广泛用于畜禽呼吸道、胃肠道、泌尿道感染。
但是，更常用于家禽住白细胞原虫病与球虫病爆发时的紧急治疗用药。对猪弓形体病亦有很高疗效。本品为较新的长效磺胺药，抗菌谱与磺胺嘧啶近似，但抗菌作用和对动物感染的保护效能均较其他磺胺药为强。

磺胺间甲氧嘧啶为长效磺胺类药物，对非产酶金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、克雷伯菌属、沙门菌属、志贺菌属等肠杆菌科细菌、淋病奈瑟菌、脑膜炎奈瑟菌、流感嗜血杆菌具有抗菌作用。磺胺类药物为广谱抑菌剂．其作用机制为在结构上类似对氨基苯甲酸(PABA)，可与PABA竞争性作用于细菌体内的二氢叶酸合成酶，从而阻止PABA作为原料合成细菌所需的叶酸，减少具有代谢活性的四氢叶酸的量，而后者则是细菌合成嘌呤、胸腺嘧啶核苷酸和脱氧核糖核酸(DNA)的必需物质，因此抑制了细菌的生长繁殖。

临床常用磺胺间甲氧嘧啶钠，磺胺间甲氧嘧啶钠的制备方法包括以下步骤：
（1）将磺胺间甲氧嘧啶、氢氧化钠加入有机溶剂中，在54~98℃温度条件下，搅拌反应0.5-2小时，得溶液A；
（2）向溶液A加入活性炭，搅拌脱色0.3-0.8小时，趁热过滤，得滤液；
（3）滤液先自然冷却到20~30℃，再在0~5℃下，保温1-3小时，过滤，得滤渣；
（4）用少量无水乙醇洗涤滤渣，在55~60℃真空干燥2-4小时，得到磺胺间甲氧嘧啶钠。