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全基因组甲基化测序的优势

发布日期:2020/2/3 10:26:21

全基因组甲基化测序概述[1][2]

DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要的作用。全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS),其采用亚硫酸氢盐处理基因组DNA使未甲基化修饰的胞嘧啶C转化为尿嘧啶U,通过对处理后的DNA进行全基因组重测序,并与参考基因组进行比对,从基因组水平实现单碱基分辨率的、高精确度甲基化水平分析,广泛应用于细胞分化、组织发育等基础机制研究,以及动植物育种、人类健康与疾病治疗等研究领域。

全基因组甲基化测序技术流程图[1]

全基因组甲基化测序优势[1][2]

全基因组甲基化测序在1992年由Frommer等提出被公认为一项革命性的创新,已成为绘制单碱基DNA甲基化图谱的首选方法。该方法因其通量高、耗时少、单碱基分辨率、高覆盖率的优势被称为甲基化测序的“黄金标准”。
测精度高:单碱基分辨率,精确分析每一个C碱基的甲基化状态;

检测范围广:借助高通量测序平台,对全基因组范围内甲基化区域进行研究;

可靠性高:直接对甲基化片段进行测序和定量,无交叉反应和背景噪音;

性价比高:相比传统PCR+Sanger测序方法,使用抗体富集高甲基化区域测序,费用少。

主要参考文献

[1]段昕妤,肖蘅,陈善元。DNA甲基化测序技术及其在哺乳动物中的应用研究进展。《生物学杂志》2018年第5期79-82,86共5页。

[2]赵亚涵。牛体内、外囊胚全基因组甲基化测序及分析。中国农业科学院学位论文。

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