染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白质与DNA相互作用的经典技术,被广泛应用于转录因子结合位点或组蛋白修饰位点的研究。
云序生物ChIP-Seq服务,将ChIP和高通量测序技术结合,在全基因组范围内高效地检测与特定转录因子或组蛋白结合的DNA位点。
技术优势 - 优化的ChIP流程:ChIP富集效率是ChIP-Seq成败的关键,云序生物采用商业化ChIP试剂盒和优化的实验流程,确保客户获得优质的数据
- 严格的质控:云序生物对ChIP-Seq实验的各个环节进行严格的质控,尽可能地降低实验风险
- 专业的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求
数据分析 基本分析 | 高级分析 |
1. 原始数据整理,过滤和质量评估 | CS-CHI-001. 蛋白结合基因的GO和信号通路分析 |
2. 序列匹配与数据统计 | CS-CHI-002. 蛋白在样品间差异结合分析 |
3. 图形化展示测序reads的基因组分布 | CS-CHI-003. 差异结合基因的GO和信号通路分析 |
4. 蛋白结合区域识别(peak calling) | |
5. 蛋白结合区域注释,分布统计 | |
数据展示 云序生物技术服务列表1. 测序服务 转录组 | 表观遗传组 | 基因组 |
真核生物 | 原核生物 |
miRNA测序 | 细菌sRNA测序 | MeDIP测序 | 目标序列靶向测序 |
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) | 原核生物mRNA测序 | RRBS测序 | 外显子组测序 |
lncRNA测序 | 宏转录组测序 | 全基因组甲基化测序 | 人类基因组重测序 |
环状RNA测序 | 原核生物转录组测序 | ChIP测序 | 16S rDNA测序 |
mRNA测序 | 原核De novo转录组测序 | | 宏基因组测序 |
RIP测序 | | | |
降解组测序 | | | |
转录组测序 | | | |
De novo转录组测序 | | | |
2. 生信服务 & PCR技术服务 生信服务 | 实时定量PCR服务 |
转录组 | 表观遗传组 | 基因组 | 联合分析 |
环状RNA分析 | DNA甲基化分析 | 基因组分析 | circRNA-miRNA | 功能分型PCR芯片 |
lncRNA分析 | ChIP测序分析 | 微生物菌落分析 | LncRNA-mRNA | 环状RNA实时定量PCR |
mRNA分析 | | 宏基因组分析 | LncRNA-miRNA-mRNA | LncRNA实时定量PCR |
microRNA分析 | | | | miRNA实时定量PCR |
细菌sRNA分析 | | | | mRNA实时定量PCR |
宏转录组分析 | | | | |