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发布人:杭州欣贝莱生物科技有限公司
发布日期:2026/7/2 12:07:54
近日,欣贝莱计算团队接受行业媒体智药局深度专访,系统探讨了欣贝莱从组学到“AI+生物制造”的融合创新路径,并首度公开由团队自主研发构建的国内首个「组学+」酶源智能体 SynGears Omni 。
利用组学进行深度基因挖掘和解析,是生物制造“第一公里”。SynGears Omni 通过赋能平台“组学源头”新能力并结合AI智能体调度,不仅能完成基因组、转录组、代谢组数据的全自动解析,还能将分析结果直接对接下游的酶挖掘、蛋白设计与目标产物合成通路筛选。
作为行业中第一个将“组学源头挖掘”作为新增能力、并与下游生物制造打通的商用智能体,SynGears Omni 首次实现了从原始测序数据到生物制造工业转化端到端全自动贯通。该平台将助力AI+生物制造从“片段式创新”进入“源头式创新”,从“半路出发”变成“从源头直达产品”。
组学是酶、蛋白与功能基因从头发现的核心源头,然而传统组学工作流长期面临四大瓶颈:①工具碎片化:分析软件散布于不同生态,从容器镜像、包管理器到源码编译,安装与依赖管理本身就是一道门槛;②策略不统一:不同物种、基因组规模和测序类型需要灵活切换分析策略,湿实验与干实验之间鸿沟显著;③成本高昂:大型基因组组装成本可达数十万元,外包模式下周期长、沟通成本高;④数据受限:公开数据库分散不全,国内访问 NCBI 等海外组学资源时常受限,给科研带来不确定性。 与此同时,多数 AI 生物制造平台仍停留在已知蛋白改造或已知菌株优化层面,缺乏从原始组学数据出发、直达产物合成的端到端能力。 SynGears Omni 正是为填补这一空白而设计。 其并非传统意义上的组学分析平台,而是建立在玄珠计算核心蛋白平台 SynGears 之上的升级版本——通过引入多组学分析模块与 AI 智能体架构,平台得以同时理解组学数据与蛋白信息,将过去分散在多个软件、多个研究环节中的工作流整合到同一系统中。 图|SynGears Omni核心架构 设想一下,面对一个刚完成测序的非模式生物基因组,过去你往往需要同时掌握基因组学、生物信息学、蛋白设计、化学等知识,熟悉十余种软件与复杂命令行工作流,串联多个课题组协同验证。 而在 SynGears Omni 平台上,你只需要用自然语言问一句:"这个物种里有没有可能合成抗癌化合物 X 的酶?"然后去喝杯咖啡,平台就能自动完成基因组解析、候选酶筛选与联合推理。 图|SynGears Omni 基因组组装注释自动化工作流 在约 400 Mb 真核基因组全自动组装与注释的实测案例中,SynGears Omni 在两天内完成了传统人工流程约两周的工作量,验证了端到端自动化的实际效能。 组学能力并非 SynGears Omni 的终点,而是其发现新酶、连接蛋白设计、赋能生物制造的重要入口。在决策协同、信息集成、工业应用、数据安全四个方面,平台具备显著优势,特别适应于研发团队满足组学+酶学的全链路需求。 ① 决策协同:五智能体集群 × 决策树调度 SynGears Omni 由 5 个子智能体协同工作,支持自然语言交互,集成可视化界面与全程任务监控,日志、版本、参数与 DAG 图全保存,结果可 100% 重现,实现类似专属生信专家团体的全程托管体验。 图|与SynGears OmniAI助手通过自然语言对话 平台采用决策树智能调度,根据物种与数据类型自动选择分析策略,并具备异常监控与动态调整能力,有效降低模型幻觉风险。 此外,SynGears Omni 还具备自进化能力:智能体可读取用户使用偏好,将其沉淀至 Memory 中,持续推荐更优参数与解法,越用越贴合科研场景。 ② 信息集成:自建数据基座,持续生长的知识图谱 面对业内数据散落、获取受限的普遍困境,欣贝莱创新打造了自主运转的专属生物数据平台——它不是简单的信息仓库,而是一个持续生长、自我更新的数字生命图谱——通过将散落全球的物种基因组片段、进化线索与注释信息熔炼成一张覆盖植物、动物、真菌等万千生命形态的内在网络,为多组学分析提供底层数据支撑。 凭借该本地化信息中枢,SynGears Omni 可实现数据稳定调度与快速响应,避免传统流程中"借道"海外访问带来的网络波动与权限限制。 值得一提的是,该数据平台每周与全球三大数据库同步进化,真正实现数据获取的“零延迟、全自主”。 ③ 工业应用:从基因组到高价值分子的端到端发现 SynGears Omni 在生物制造领域,尤其是各类高价值功能分子(如天然产物活性分子等)研究中表现出色。它能够从多组学数据中定向挖掘目标产物合成途径及关键酶,结合目标产物分子特性进行分子对接与虚拟筛选,有效降低假阳性率。 图|SynGears Omni 的MD模拟与机理解析可视化界面 以天然产物研究为例,酶冗余一直是关键难点:一个酶可能催化多个反应,多个酶也可能催化同一个反应。面对未知途径,SynGears Omni 可一键完成基因组学层面的酶挖掘,并通过蛋白质结构与相互作用分析预测酶功能,为湿实验验证提供高价值候选对象,显著加速目标产物相关酶筛选与路径优化。 此外,SynGears Omni 还能对预测的酶–底物候选对进行自动判断与解析,筛选出更具参考价值的结果,为实验室验证提供可直接操作的对象。 ④ 数据安全:本地化部署,封装即插即用 针对核心菌株、专有序列等工业生物资产的高敏感数据,SynGears Omni 从底层架构上保障数据本地化与自主可控。 平台支持本地部署与容器化运行,所有数据保留在用户本地服务器内运行与存储,不上传、不外传,既保障数据安全与隐私合规,也适用于涉及核心菌株、专有序列及工业生物数据的研究场景。 封装设计还带来了显著的使用便利:SynGears Omni 就像一个自带环境的便携箱,复杂基因组与大基因组可在不同服务器之间轻松迁移,无需逐台重新配置依赖,即插即用,大幅降低部署与维护门槛。 SynGears Omni 目前处于系统内测阶段,尚未对外开放访问,预计将于2026年下半年正式开放公测。 图|扫码咨询服务 抢先体验SynGears Omni核心功能 如果您的研究涉及非模式生物基因组组装与注释、天然产物合成通路挖掘与关键酶发现、工程菌种系统优化与代谢路径设计、多组学数据联合分析与智能推理等场景,欢迎扫码咨询。 我们的团队将在收到需求后24小时内与您联系,为您出具针对性的定制化解决方案。 SynGears Omni 的组学能力与智能体架构并非凭空而来,而是建立在欣贝莱生物长期积累的"AI+合成生物"技术体系之上。 作为国内最早将 AI 引入合成生物学研究的团队之一,欣贝莱在 AI 驱动的酶蛋白理性设计领域早已积累了丰富经验:依托核心平台开发出 BioFlux 双模块自动化工作流,整合多算法实现从高通量蛋白筛选到高精度结构分析的全链条自动化,日均可筛选超 300 万种配体-受体组合,完成传统湿实验数月的筛选任务。 图|双模块自动化工作流BioFlux 1.0 在此基础上,团队通过 AI 驱动的理性设计与机器学习辅助的定向进化策略,已成功开发出系列高性能酶突变体并完成产业转化:羰基还原酶突变体实现抗癌药物劳拉替尼关键手性中间体的高效酶法合成;酮还原酶突变体攻克偏头痛重磅药物瑞美吉泮的手性中间体合成瓶颈;酮还原酶突变体(另一分支)应用于早泄治疗药物达泊西汀中间体的高手性纯度合成。 相关技术与工艺均已获得国家发明专利授权,充分验证了欣贝莱在 AI 驱动酶设计领域的源头创新能力。 图|相关技术与工艺获国家发明专利授权 在基因组挖掘方面,欣贝莱团队同样成果扎实:国际上首次完成超 10Gb 喜马拉雅红豆杉染色体级别全基因组测序,并构建迄今组装质量最高的裸子植物基因组;首次构建小粒咖啡近 T2T 基因组组装,并创新发现莱鲍迪苷 M 一步法合成酶,助力其高效生物合成。 图|相关成果发表于国际知名期刊《Molecular Plant》 这些能力最初沉淀为玄珠计算的核心蛋白计算平台 SynGears。如今,欣贝莱将多年积累的组学分析经验、天然产物研究方法学与智能体技术融合其中,升级形成「组学+」酶源智能体SynGears Omni 。 图|SynGears正式升级为SynGears Omni 正如欣贝莱团队在采访中所表达的信念:生物学的复杂性并不是 AI 的障碍,而恰恰是 AI 最应该发光的地方。 "SynGears Omni 开放的不只是计算工具,更是欣贝莱多年来在高附加值功能分子绿色高效合成研究中积累的分析逻辑和领域知识。希望它能成为行业内更多研究者的基础设施,共同加速天然产物这一宝库的开发进程。 我们也诚挚欢迎有共同愿景的研究者、合作伙伴与我们一起完善这个平台——用户的每一次使用和反馈,都是让Syngears Omni变得更聪明的养料。" 图|欣贝莱计算团队 未来,欣贝莱还将进一步完善 SynGears Omni 多子智能体协同架构,推进容器化与本地 APP 化部署,持续升级数据库与组学分析能力,逐步扩展至代谢组、宏基因组、泛基因组、单细胞组学等方向,专注打造国内生物制造领域领先的端到端 AI 智能体。SynGears Omni 核心优势 ?
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作为一家专注于“AI+合成生物”交叉领域创新的数字化生物科技企业,欣贝莱生物始终以自主研发的前沿“AI+合成生物”研发大平台为核心驱动力,深度赋能从酶挖掘到工艺放大的全链条研发。目前,公司已成功将底层技术转化为覆盖医药中间体、健康糖与功能甜味剂、保健与护肤原料等多个领域的系列化高价值产品。
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