新物种DE NOVO 转录组测序

新物种denovo转录组测序是指在所研究的物种不具备参考基因组时，通过denovo分析策略，转录组测序可以帮助研究人员快速获取该物种的mRNA序列，并预测可能的非编码RNA。此外，在分析基因表达水平的同时，还可以获得cSNP，从而提供全面的转录组信息。有研究对兜兰（Paphiopedilum）单独开花行为与简单重复序列标记的开发利用进行了深入的研究。通过新物种denovo转录组测序服务对同色兜兰（Paphiopedilumconcolor）、带叶兜兰（Paphiopedilumhirsutissimum）以及两个栽培品种进行了测序。通过测序，研究人员发现了一些与单独开花行为有关的转录因子。同时还找到了20969个可用于分子标记的EST-SSR以及15137个引物SSR。该工作为人们对兜兰开花与花的发育的分子机制有了一定的了解。