链特异性转录组测序

链特异性转录组测序是指在文库构建过程中将RNA链的方向信息保存到测序文库中，测序后的数据分析可以确定转录本是来自正义链还是反义链。链特异性建库的方式是在合成cDNA的第二条链时，用dUTP替换dTTP。待链合成后，再用USER酶降解cDNA的第二条链并再次进行PCR扩增，完成文库的制备。运用这种方法，可以在测序后的数据分析过程中确定转录本是来自正义还是反义DNA链。与非链特异性转录组测序相比，此方法更能准确地统计转录本的数量和确定基因的结构，同时可以发现更多的反义转录本，目前被广泛地应用于研究基因结构和基因表达调控等领域范围。