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Human靶向甲基化测序服务特点

发布日期:2020/2/6 10:10:28

概述[1-2]

甲基化就是人体内新陈代谢产生的“甲基分子集团”贴到了蛋白质、脱氧核糖核酸(DNA)和其他分子上。它是遗传基因调控生命活动的重要化学反应,参与胚胎发育、衰老、肿瘤发生等诸多生理、病理过程,是身体正常运转保持自然健康状态所必需的。

Human靶向甲基化测序又叫人靶向甲基化测序,人甲基化测序系统 (Human Methyl-Seq) 是全面的靶向序列捕获系统,可帮助研究人员关注那些已知甲基化可影响基因调节的区域:CpG islands、CpG island shores、CpG island shelves、undermethylated 区域、启动子及差异性甲基化区域 (DMR)。

服务特点[2]

人甲基化测序系统通过检测单独的 CpG 可独具特色地提供比甲基化芯片更多的信息,相比全基因组重亚硫酸盐测序,可提高通量并降低成本,可发现限制性内切酶及免疫沉淀或 SNP 相关方法所不能检测的甲基化区域优势, 84 Mb 设计覆盖 370 万 CpG,不依赖于甲基化状态的探针,高灵敏度,分辨率可达到单个碱基,提高通量并降低成本。与现有甲基化方法相比,可降低偏差 (bias) , 人甲基化测序系统测序类型包括CpG 岛, GENCODE 启动子, 癌症、组织特异性 DMR,或以下类型的调控序列:-CpG Islands, shores/shelves (±-4 kb) -增强子-Ensemble 调控区域-DNase I 高敏感位点。用于 DNA 甲基化分析的GeneSpring NGS 软件,快速实现甲基化水平、CpG 区域覆盖、读长对齐和碱基质量的可视化,通过单碱基对分辨率鉴定甲基化状态并利用特定目标基因重叠,获得深入的生物学见解,发现 DMR 和 DMC 的基因和基因间效应,并将其同 QPCR、ChIP测序和 RNA 测序结果相关联。

工作流程[2]

参考文献

[1] 新编老年学词典

[2] Human靶向甲基化测序技术说明书

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