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环状RNA测序的介绍

发布日期:2020/1/1 10:28:37

背景及概述[1]

环状RNA(circularRNA,环状RNA)又称环形RNA,是新近确认的一类特殊的非编码RNA(ncRNA),主要由外显子和(或)内含子构成。近年来研究发现,在某些疾病(如肿瘤、动脉粥样硬化、糖尿病、神经系统疾病)的发生发展过程中环状RNA起着重要的调控作用,这不仅使我们对环状RNA有了更好认识,而且在某些疾病的诊断、治疗及预防方面也为我们提供了新的研究方向。近年来随着生物测序技术的发展,越来越多的环状RNA逐渐被发现,同时有关环状RNA的起源、特征、作用以及与疾病关系之类的报道也越来越多,特别是相关环状RNA数据库的建立,为我们在环状RNA的研究过程中奠定了基础。据以往有关环状RNA与疾病的报道发现,目前大部分还处于探索阶段,而有关疾病诊断、治疗方面的研究还知之甚少,特别近年来随着精准医疗的提出,今后有关疾病诊断及治疗将逐渐侧重基因方面,而环状RNA作为一类特殊的非编码RNA,因其固有的特征,今后可能在这方面发挥巨大作用。

环状RNA测序原理是由于环状RNA的闭合环状特性,通过去除totalRNA中的rRNA和线性RNA分子,可以特异地富集环状RNA分子后测序,更有针对性地分析受检样本中特定的环状RNA谱、环状RNA剪接模式、组间差异和分子功能等。有研究利用环状RNA测序探究大鼠肝再生过程中环状RNA表达特征。利用环状RNA测序共筛选获得在肝再生中差异表达的159个环状RNA。通过GO和KEGG对差异环状RNA进行功能富集分析并构建了环状RNA-miRNA互作网络。最后,通过qRT-PCR验证了可能在肝再生中发挥重要调控作用的环状RNA。

主要参考资料

[1] 环状RNA的研究进展

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