Illumina 动植物全基因组SNP芯片服务的介绍

背景及概述^[1]

Illumina 动植物全基因组SNP芯片服务包括Illumina 动物全基因组SNP芯片服务和Illumina 植物全基因组SNP芯片服务。其中Illumina 动物全基因组SNP芯片服务物种包括牛、羊、马、猪、犬。

1）牛芯片名称为Bovine HD BeadChip，是Illumina公司与牛类研究专家联合开发出牛高密度SNP芯片，每个样本可检测777962个SNPs。

2）羊：Ovine SNP50 BeadChip。该芯片由Illumina公司与国际羊基因组协会专家联合开发，它包含54241个SNP位点。平均每46kb有一个标记，覆盖整个基因组。

3）马：Equine SNP50 BeadChip。该芯片包含54602个SNP位点，这些位点均一分布在15个品种马匹的全基因组序列上，SNP的平均间隔为43.2kb。

4）猪：Porcine SNP60 BeadChip。

该芯片包含62163个SNP位点，覆盖猪的全基因组。此款芯片整合了多种猪的基因差异，包括杜洛克猪、长白猪，皮特兰猪和大白猪。5）犬：Canine HD BeadChip。该芯片包含超过17万个SNP位点，可以对任何一种家养犬类进行全基因组扫描。Illumina 植物全基因组SNP芯片服务物种包括玉米、甘蓝、樱桃、桃子、大豆、辣椒、小麦、苹果、葡萄、燕麦、番茄、小麦、大麦、马铃薯、向日葵、棉花、水稻、豆类等，其中玉米芯片名称为Maize SNP50 BeadChip，该芯片包含56,110个玉米SNP位点；甘蓝芯片名称为Intl Brassica SNP Consortium，该芯片包含52,157个甘蓝SNP位点。其他植物品种也均有自己的芯片名称。

主要参考资料

[1] Illumina芯片服务平台介绍