适体修饰热启动酶的热启动改造与修饰
发布日期:2020/1/1 10:28:37
背景[1]
适体修饰热启动酶(Hotstart Taq DNA Polymerase)是一种适体基团修饰的耐热性Taq DNA聚合酶,高温加热前,适体修饰基团与Taq酶结合,抑制聚合酶的活性,避免了引物延伸的非特异性扩增或引物二聚体的产生,增强了DNA扩增的特异性,灵敏度和稳定性,广泛适用于常规PCR,多重PCR及巢式PCR等。经过95°C热激10 min后,该酶即可恢复活性。
适体修饰热启动酶没有检测到3′→5′校对外切酶活性,但具有5′→3′外切酶活性,可用于荧光定量PCR的检测。Hotstart Taq DNA Polymerase在常温下没有活性,便于PCR实验的常温操作。
提高适体修饰热启动酶耐热性[2]
Stofell片段是 Taq DNA聚合酶通过缺失突变去除N端第1-289个氨基酸而得到的。实验证明,全长 Taq DNA聚合酶在97.5℃加热9min还可以保持一半以上的活性,而 Stofell 7在97.5℃则可以持续21min保持一半以上的活性Klentaq也是一种 Taq DNA聚合酶的突变体,它也比 Taq DNA聚合酶具有更高的热稳定性。在应用方面,去掉N端5-3外切酶活性以后的大片段 Taq DNA聚合酶的耐热性提高,变性温度可达到98℃,更适合扩增GC含量高和二级结构强的模板,结合其所具有的3-5外切校正功能,使其具备了扩增长链DNA的能力,可以扩增35kb以上的模板。除此之外,去除大片段 Taq DNA聚合酶表面的10个不稳定的氨基酸,并且加入两个硫水氨基酸后,酶的活性和热稳定性都会有所提高。
热启动改造与修饰[3]
Taq DNA聚合酶在75℃-80℃时活性最高,但是在温度较低时,该聚合酶的活性也依然存在。这就使得在PCR反应的初始阶段,由于引物的量比模板的量高出很多,在仪器升温过程中,很容易出现引物互搭或引物与模板中的一些非靶位点错配的现象,在DNA聚合酶的作用下进行延伸,形成引物二聚体和非特异性产物。这些引物二聚体和非特异性产物又可作为引物或模板在以后的PCR循环中继续扩增,使非特异产物不断扩增和累积。如果PCR的循环数较多、扩增子的GC含量较高以及多重PCR体系,也很容易产生引物二聚体和非特异性产物,既降低了目的产物的扩增效率,又影响PCR在检测及测序等方面的应用。
方法有:基因突变、化学修饰、抗体修饰法、核酸适配体修饰。
参考文献
[1] 适体修饰热启动酶产品介绍
[2] Taq DNA 聚合酶的结构修饰与表征.郭佳
[3] Poddar S, Sawyer M, Conor J. Effect of inhibitors in clinical specimens on Taq and Tth DNA polymerase-based PCR amplification of A virus .Journal of Medical Microbiology.
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