RS琼脂的应用

背景^[1-3]

RS琼脂用于气单胞菌的分离培养。RS琼脂中L-赖氨酸提供氨基酸，L-盐酸鸟氨酸、L-半胱氨酸盐提供氮源，麦芽糖提供碳源为可发酵的糖类，硫代硫酸钠和枸橼酸铁铵用于检测硫化氢的产生，使菌落中心呈黑色，脱氧胆酸钠抑制革兰氏阳性菌，氯化钠维持均衡的渗透压，酵母提取物提供碳源、氮源、维生素和生长因子，新生霉素可提高抑菌性，溴麝香草酚兰是指示剂，产酸时培养基由绿色变为黄色，琼脂是凝固剂。

气单胞菌属属于气单胞菌科，广泛分布于自然界，可从水源、土壤以及人的粪便中分离。本属细菌有的种可引起人类和动物肠炎、败血症等多种疾病。气单胞菌属属于革兰阴性短杆菌，大小为（1～4）μm×（0.1～1）/μm，菌体两端钝圆，单极鞭毛，运动极为活泼（除杀鲑气单胞菌外）。无芽胞，有窄的荚膜。

气单胞菌在血琼脂上形成灰白、光滑、湿润、凸起直径约2mm的菌落，多数菌株有β溶血环，3～5天后菌落呈暗绿色；在肠道选择培养基上，大多数菌株形成乳糖不发酵菌落；在TCBS琼脂上生长不良；液体培养基中呈均匀混浊。

应用^[4][5]

用于斑马鱼肠道菌群协同竞争关系对嗜水气单胞菌感染的影响研究

动物肠道中存在着大量的微生物,在机体生长发育,营养代谢,免疫疾病等生物过程中扮演着重要的角色。随着高通量测序和数据分析技术的快速发展,肠道微生物的研究进入一个更深入的层次。

基因组测序结果表明正常动物肠道携带着大量病原微生物,正常情况下并未表现出致病性,但在肠道菌群紊乱时表现出强烈致病性,表明细菌性疾病的的发生可能依赖于肠道菌群结构组成和菌群之间的相互作用。

气单胞菌作为一类常见的淡水鱼类病原菌,是引起细菌性败血病主要病因,每年给水产养殖造成巨大的经济损失。研究表明,气单胞菌致病性受到外部环境的影响,而且气单胞菌引起的败血症存在与其他肠道病原菌混合感染的现象,推测气单胞菌感染依赖与肠道微生物的群落组成以及相互作用。

故本研究选用抗菌药干扰肠道菌群并结合高通量测序以及网络分析技术,来研究斑马鱼肠道菌群协同竞争关系对嗜水气单胞菌感染的影响,研究结果如下:1.抗菌药对斑马鱼肠道菌群组成的影响斑马鱼肠道菌群主要由变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)组成。甲硝唑处理(J组)以及联合处理组(L组,甲硝唑、头孢他啶、左氧氟沙星联合处理)后的2、7天都能显著改变肠道菌群组成,主要是提高变形菌门比例和降低厚壁菌门以及梭杆菌门的比例,抗菌药处理后17天,甲硝唑处理以及联合处理对斑马鱼肠道菌群组成以及β-多样性与对照组(Z组)相比无显著差异。

2.抗菌药对斑马鱼肠道菌群网络关系的影响抗菌药能够使菌群形成不同的网络关系,对比对照组,甲硝唑处理和联合处理,都增加了网络图的节点数(Z=329,J=361,L=571)以及连接数(Z=1123,J=1475,L=2781),使网络关系变得更复杂。在17天时,甲硝唑处理以及对照组的网络关系中存在更多的竞争关系(负/正连接数比,Z=0.21,J=0.32),而联合处理组网络关系中存在更多协同关系(负/正连接数比,L=0.02)。

参考文献

[1]Effects of host species and environment on the skin microbiome of Plethodontid salamanders[J].Carly R.Muletz Wolz,Stephanie A.Yarwood,Evan H.Campbell Grant,Robert C.Fleischer,Karen R.Lips.Journal of Animal Ecology.2018(2)

[2]Host modification of a bacterial quorum-sensing signal induces a phenotypic switch in bacterial symbionts[J].Cleo Pietschke,Christian Treitz,Sylvain Fore?t,Annika Schultze,Sven Kunzel,Andreas Tholey,Thomas C.G.Bosch,Sebastian Fraune.Proceedings of the National Academy of Sciences.2017(40)

[3]Impact of molecular hydrogen treatments on the innate immune activity and survival of zebrafish(Danio rerio)challenged with Aeromonas hydrophila[J].Zhenyu Hu,Bingqian Wu,Fanhong Meng,Zejian Zhou,Hui Lu,Heng Zhao.Fish and Shellfish Immunology.2017

[4]The scales of the zebrafish:host–microbiota interactions from proteins to populations[J].Adam R Burns,Karen Guillemin.Current Opinion in Microbiology.2017

[5]查继伟.斑马鱼肠道菌群协同竞争关系对嗜水气单胞菌感染的影响[D].西北农林科技大学,2019.