简化基因组测序的技术优势

概述^[1]

简化基因组测序(Reduced-Representation Genome Sequencing, RRGS)方法，即通过限制性内切酶切开基因组DNA，对指定部分采用高通量测序，并得到大量遗传多态性标签序列，以将物种全基因组的测序对策充分展现出来。该方法可减少基因组的复杂度，使实施过程简便，费用少，同时不依靠参考基因组也能得到全基因组中的遗传多态性标签，因此，在基因学和进化学中被大量应用。现阶段简化基因组测序主要包括简化代表文库测序(reduced-representation libraries, RRLs)、特异性位点扩增片段测序(specificlengthamplificationfragmentsequencing，SLAF-seq)以及基于限制性酶切位点DNA测序(restriction-siteassociatedDNAsequencing，RAD-seq)。

简化基因组测序技术优势^[2]

简化基因组测序(Reduced-Representation Genome Sequencing, RRGS)能大幅降低基因组的复杂度，显著降低测序成本，快速鉴定高密度ＳＮＰ位点，常用于遗传变异检测、高密度遗传图谱构建、重要性状候选基因定位和群体遗传进化分析。常用于动物基因组研究的简化基因组测序技术主要有简化代表文库测序(RRLS)和限制性酶切位点关联ＤＮＡ测序(RAD-seq)。

应用领域

简化基因组能获得全基因组范围内有代表性的遗传多样性位点，因而广泛应用于群体进化、群体结构、种群历史、遗传定位和连锁图谱的构建。

主要参考资料

[1] 胡亚亚，刘兰服，冀红柳，韩美坤，焦伟静，高志远，马志民.简化基因组测序技术研究进展。江苏师范大学学报(自然科学版）。

[2] 李国治，邓卫东。基因组测序技术及其应用研究进展。安徽农业科学，Ｊ．Ａｎｈｕｉ Ａｇｒｉｃ．Ｓｃｉ．２０１８，４６（２２）：２０－２２，２５