基因甲基化分析的应用

概述^[1]

基因甲基化是指在甲基转移酶家族的作用下将甲基转移至胞嘧啶C5位上,形成5-甲基胞嘧啶,多发生在富含CpG碱基的CpG岛上,是表观遗传修饰的一种,CpG岛的甲基化通常导致基因表达的稳定沉默。每个甲基化位点由局部的DNA甲基转移酶、DNA去甲基化酶的活性和DNA转录效率决定,而且DNA甲基化受到表观遗传修饰网络调控。甲基化DNA免疫共沉淀测序技术是通过抗5-甲基胞嘧啶抗体特异性结合DNA5-甲基胞嘧啶的方式,富集全基因组中的DNA甲基化区段,进行高通量测序,以探测全基因组范围内高精度甲基化状态。基因甲基化分析是基因甲基化的一种分析方法。

应用^[2]

基因甲基化分析是目前研究较为透彻的表观遗传修饰方法，作为一种重要并相对稳定的表观遗传修饰策略，DNA 甲基化通过稳定染色质结构、调控基因表达、参与基因重组等方式，在原核生物、动物、植物等多种生物的基本生物学过程中发挥重要作用。在真菌中，DNA 甲基化可能参与形态建成、逆境胁迫和次级代谢过程，但对其具体功能研究较少。目前，对基因组甲基化水平分析手段主要采用甲基化敏感扩增多态性（methylation sensitive amplification polymorphism，MSAP）技术，利用同尾酶 Hpa II和 Msp II对 CCGG序列中的胞嘧啶甲基化反应的不同，对基因组范围内的甲基化状态变化进行分析。

主要参考文献

1.黄金献,李栋,李聪,时庆,鞠秀丽。三维和二维培养的脐带间充质干细胞DNA甲基化水平比较。山东大学学报（医学版）第57卷第11期。

2.宋 爽，刘 宇，高 琪，赵 爽，王守现，宋庆港。高温胁迫下香菇基因组甲基化差异分析。中国食用菌 2019，38（10）：9-11，16。