2'-デオキシ-5-メチルシチジン

化学名:2'-デオキシ-5-メチルシチジン

CAS番号.838-07-3

英語名:5-Methyl-2'-deoxycytidine

CBNumberCB1132913

MFC10H15N3O4

MW241.24

别名

2'-デオキシ-5-メチルシチジン

5-メチル-2'-デオキシシチジン

1-(2-デオキシ-β-D-erythro-ペントフラノシル)-5-メチルシトシン

2'-デオキシ-5-メチルシチジン物理性質

融点	217-219 °C(lit.)
沸点	492.8±55.0 °C(Predicted)
比重(密度)	1+-.0.1 g/cm3(Predicted)
屈折率	44 ° (C=1.4, H2O)
貯蔵温度	Keep in dark place,Sealed in dry,Room Temperature
溶解性	DMSO(微熱)、メタノール(微熱)、水(微熱)
外見	粉
酸解離定数(Pka)	pK1:4.33 (25°C)
色	ホワイトからオフホワイト
旋光度（Optical Rotation）	41.1°(C=0.009986 g/ml H2O)
水溶解度	水に溶ける。
安定性：	吸湿性
InChI	InChI=1S/C10H15N3O4/c1-5-3-13(10(16)12-9(5)11)8-2-6(15)7(4-14)17-8/h3,6-8,14-15H,2,4H2,1H3,(H2,11,12,16)/t6-,7+,8+/m0/s1
InChIKey	LUCHPKXVUGJYGU-XLPZGREQSA-N
SMILES	OC[C@H]1O[C@@H](N2C=C(C)C(N)=NC2=O)C[C@@H]1O
CAS データベース	838-07-3(CAS DataBase Reference)

安全性情報

危険有害性情報のコード(GHS)

外観
白色〜わずかにうすい褐色, 結晶性粉末〜粉末
溶解性
メタノールに溶ける。
使用上の注意
不活性ガス封入
化学的特性
White Solid
使用
5-Methyl-2'-deoxycytidine is a pyrimidine nucleoside that when incorporated into single-stranded DNA can act in cis to signal de novo DNA methylation. It has been used in epigenetics research to investigate the dynamics of DNA methylation pattern in the control of gene expression.
一般的な説明
Giel-Pietraszuk et al. developed a new method for quantification of 5-methyl-2'-deoxycytidine (m5C) in the DNA. The technique is based on the conversion of m5C into fluorescent 3, N4-etheno-5-methyl-2'-deoxycytidine (εm5C) and its identification by reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC)[1].The measurement of 5-meC and 5-medC in urine may help assess changes in DNA methylation status in the whole body and investigate the DNA demethylation mechanism in vivo. 5-MedC was first detected in urine using an inhibition ELISA method;12 however, because ELISA may suffer from poor selectivity and sensitivity, later urinary measurements of 5-medC were developed mainly based on the chromatographic techniques[2].
概要
遺伝子の発現を抑制するDNAのメチル化ではシトシンの5位がメチル化され5-メチルシトシン(DNA中ではデオキシ-5-メチルシチジン)が生成する