在基因组上,有很多开放的染色质区域,是转录因子和转录元件的重要结合位点。 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using Sequencing)就是一种研究染色质开放区域(即未被组蛋白保护的开放区域)的生物学方法,仅需要很少的细胞就能鉴定基因组中所有活跃的调控序列。该技术利用T5转座酶,将测序的adaptor插入这些开放的转录因子结合区域,以优先标记和检测核小体之间的DNA序列,从而可以获得转录因子结合位点等关键信息。 目前ATAC-seq已被广泛应用于转录调控序列的鉴定及真核细胞的重编程研究。