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ATAC-seq

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上海 更新日期:2019-12-18

上海凌恩生物科技有限公司

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产品详情:

英文名称:
ATAC-seq
在基因组上,有很多开放的染色质区域,是转录因子和转录元件的重要结合位点。
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using Sequencing)就是一种研究染色质开放区域(即未被组蛋白保护的开放区域)的生物学方法,仅需要很少的细胞就能鉴定基因组中所有活跃的调控序列。该技术利用T5转座酶,将测序的adaptor插入这些开放的转录因子结合区域,以优先标记和检测核小体之间的DNA序列,从而可以获得转录因子结合位点等关键信息。

目前ATAC-seq已被广泛应用于转录调控序列的鉴定及真核细胞的重编程研究。

技术流程:


技术特色:
  • 灵敏性高,低样本量需求;
  • 测序深度底,可重复性好;
  • 可一次性获得全基因组范围的染色质开放区域,不限于转录因子,包括组蛋白修饰等。


分析示例:

Peak功能元件分布统计

Peak及上下游reads表达水平热图

 
ATAC-seq;技术服务

公司简介


成立日期 (10年)
注册资本 2500万人民币
员工人数
年营业额
经营模式
主营行业

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