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发布人:上海博湖生物科技有限公司
发布日期:2026/2/4 9:45:20
在巢式PCR中,两对引物的Tm值确实需要接近,但通常内引物的Tm值应比外引物低5-10℃,这样设计是为了让两轮扩增能在同一反应体系中高效进行。
为什么Tm值需要接近?
单管巢式PCR:通过控制退火温度实现两轮扩增。先高温(如60-65℃)让外引物结合,再降温(如50-55℃)让内引物结合。
减少污染:避免开管操作,降低交叉污染风险。
如何实现Tm值接近?
调整引物长度:
外引物:25-28 bp(Tm 60-70℃)。
内引物:18-20 bp(Tm 50-60℃)。
优化GC含量:保持在40%-60%之间,避免连续3个G或C。
使用设计软件:用Primer-BLAST、OligoAnalyzer等计算和调整Tm值。
设计要点
Tm值差异:外引物Tm比内引物高4-10℃。
浓度比例:内引物浓度可为外引物的40倍以上。
验证特异性:设计后务必用BLAST比对模板序列。
总之,通过调整长度和GC含量来控制Tm值差异,是实现高效单管巢式PCR的关键。
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