免疫细胞 signaling 研究有个老难题:细胞异质性。一群免疫细胞对同一刺激的响应并不整齐,有的活化有的沉默,群体水平测信号,平均值把亚群差异抹平了。流式能到单细胞分辨率,但 panel 宽度受荧光通道数限制,十几个标记就到顶。
InTraSeq 怎么解
InTraSeq 的思路是把测序的通量借来做蛋白检测。技术骨架分三步:抗体和 DNA 标签偶联,抗体带上一段独特序列的 DNA 条码;抗体结合细胞表面的目标蛋白,胞内信号分子要先透化;测序时每个条码被读出,一个细胞对应一组条码计数。等于用测序深度换 panel 宽度,几十种蛋白标记同时读。
这套设计解决的正是开头那个难题:单细胞分辨率加宽 panel,能回答"哪一群细胞在响应刺激""响应强度和亚群的关系""稀有亚群的信号特征"。免疫治疗机制研究、细胞因子处理后的信号图谱,都是典型场景。
条码设计还有一层巧思:每个细胞的条码带唯一分子标签,测序计数时能去掉 PCR 重复,接近真实分子数。这一步让定量比早期方案扎实很多。
和流式怎么配合
和流式是互补不是替代:流式抗体库自由、周期短,适合日常分群;InTraSeq 胜在 panel 宽和单细胞深度,适合 profiling。常见打法是流式做分群验证,InTraSeq 做深度信号扫描,数据互相印证。

DNA 条码随测序读出,单细胞多蛋白一次成型,自绘示意
FAQ
Q:InTraSeq 能替代流式吗?
A:不能。流式胜在灵活和速度,InTraSeq 胜在 panel 宽度和分辨率,多数课题组两个都用。
Q:panel 宽度由什么决定?
A:由偶联抗体 cocktail 的靶点清单决定。选型前核对 cocktail 覆盖,缺的靶点确认不在任何一个 cocktail 里再决定方案。
| 名称 |
货号 |
规格 |
| InTraSeq 3' Assay Kit |
82906S |
1 Kit |
| InTraSeq 3' Conjugate Antibody Cocktail 1 |
48167 |
22 μl |
| InTraSeq 3' Conjugate Antibody Cocktail 2 |
83302 |
22 μl |
| InTraSeq 3' Conjugate Antibody Cocktail 3 |
18520 |
22 μl |