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从传统机制到结构创新 | 核苷类抗病毒药的演进与革新

发布人:上海玉函化工有限公司

发布日期:2026/7/27 10:01:02

广谱抗病毒机制与性能修饰


核苷酸衍生物 (NAs) 可被用作抗病毒药物,是目前临床上治疗艾滋病、疱疹、肝炎等病毒性疾病的首选药物。

在对抗病毒的过程中,由于其结构与天然核苷酸相似,故能够竞争性地结合病毒生命周期中发挥关键作用的DNA聚合酶逆转录酶,干扰并抑制肿瘤细胞生长。


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图1 各种核苷和核苷酸激酶激活抗病毒核苷的主要机制


NAs需要通过连续三个磷酸化步骤转化为活性三磷酸形式 (NuTP),才能发挥药效 (图1)。其中,一磷酸化由宿主或病毒编码的核苷激酶催化,通常是限速步骤,许多药物在这一阶段的激活效率低,表现出较差的药物活性。


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图2 无环核苷膦酸盐 HPMP和HPMP系列的结构


为了提高药效,激酶旁路策略可以将磷酸化核苷直接输送到细胞中,生物亲和性的磷酸保护基团可以增加磷酸分子的细胞穿透力并保持良好的溶解度。如图2所示,为了提高以HPMP为基础的核苷细胞渗透性,研究人员生成了该系列的环状版本,与羟甲基链形成内部膦酸酯键。


抗 RNA 病毒的经典药物


核苷化合物因其结构与天然核苷类似,能阻断病毒基因组的合成,是当前抗病毒药物开发的核心方向之一。以利巴韦林 (Ribavirin) 与索磷布韦 (Sofosbuvir) 为例,二者均通过模拟天然核苷,在病毒复制过程中插入RNA链中导致链终止或突变,从而抑制病毒扩散。核苷类化合物凭借其结构可修饰性和机制多样性,仍是当前抗病毒药物开发的关键分子框架。

1、利巴韦 (Ribavirin)

利巴韦林(RBV)是一种独特的核糖核苷,它的核碱基是 1H-1,2,4-三唑-3-甲酰胺4,具有多种作用机制,其中最主要的是通过RBV-MP抑制单磷酸肌苷脱氢酶导致细胞内GTP的耗竭,从而直接影响细胞和病毒的复制。

此外,利巴韦林还可能通过抑制鸟苷酸转移酶和甲基转移酶来干扰病毒mRNA部分结构的形成。然而,由于大多数病毒的RdPps缺乏校对能力,RBV可能会通过RTP对GTP的替代以增强病毒的突变能力,使得其在临床应用上受到一定局限。

2、索菲布韦 (Sofosbuvir)

与RBV抑制GTP合成扰乱病毒能源供应的机制不同,索菲布韦在穿透细胞后,被宿主酶消化和化学水解作用裂解后,释放出索菲布韦-5’-单磷酸,转化后的活性代谢物可伪装成U核苷插入RNA中引起复制终止。

除此以外,Merck公司开发的莫仑吡韦(MK-4482)能够在合成RNA过程中取代胞嘧啶或尿嘧啶,导致RNA产物发生变异,当突变累积超出了病毒生存所需的复制保真度时达到抑制效果。


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图3 常见的抗RNA病毒药物结构式


从传统抑制到碱基配对创新


除了传统的干扰核酸代谢、诱导链终止以及致突变等机制,近年来Jia等人提出了一种对正链冠状病毒和负链腺病毒均具有抗病毒活性的腺苷类似物HNC-1664。

单独进行核糖修饰的化合物可能会诱导不同RdRps (RNA依赖RNA聚合酶) 之间存在微妙的相互作用,而碱基修饰的NAs能以稳定的方式与模板核苷酸建立沃森-克里克型碱基配对相互作用,具有更为广谱的抗病毒效能。

HNC-1664通过将核苷碱基和核糖进行双重化学修饰,实现了一种“非常规碱基配对方式”,以干扰RdRps在催化前阶段的功能。


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图4 HNC-1664的结构式


HNC-1664在核糖骨架2’位引入了F修饰,可用于增强与RdRps的相互作用以及化合物的稳定性。其中,碱基采用了非典型腺嘌呤衍生物,使HNC-1664可与RdRps-RNA复合体形成“非常规碱基配对”,通过非催化性阻断机制阻碍活性构象闭合。

该二重修饰不仅增强了与RdRps结合的亲和力,也使得HNC-1664在预转录阶段通过碱基的大约180翻转实现非常规配对以高效阻断RNA合成。


未来布局与趋势展望


未来核苷类药物的发展方向将更趋精准化与多样化,包括多功能前药设计、组织特异性递送系统、以及结合AI辅助的结构预测以实现药物发现的高通量与高精度。

同时,针对病毒突变频率高的特点,非经典碱基配对异源嵌合策略有望打破现有抗药性瓶颈,为广谱抗病毒药物的开发开辟新路径。


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