MBD甲基化测序的应用
DNA甲基化是指在DNA甲基化酶作用下,DNA分子的碱基化上甲基基团的修饰过程。限制性内切酶作用位点中的特定碱基被甲基化后,则不再受该酶切割。 DNA甲基化对生命活动非常重要,是基因调控的手段之一(即,通过对位于启动子及第一外显子区的CpG岛的甲基化而抑制基因的表达),它在维持细胞正常功能、传递基因组印记,胚胎发育、肿瘤发生等方面起着至关重要的作用,更是表观遗传学研究的热点。蛋白质富集全基因组甲基化测序(Methylated DNA Binding Domain Sequencing, MBD-Seq)是采用甲基化DNA富集与高通量测序相结合的一种检测DNA甲基化的方法。由于在哺乳动物中甲基化一般发生在CpG的胞嘧啶5位碳原子上,可通过特异性结合甲基化DNA的蛋白MBD2b富集高甲基化的DNA片段,并结合第二代高通量测序,对富集到的DNA片段进行测序,从而检测全基因组范围内的甲基化位点。
2020-02-06
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