胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒的应用
发布日期:2023/12/13 9:04:26
背景[1-3]
胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒是一种用于检测胰阔圆盘吸虫的分子生物学试剂盒。胰阔圆盘吸虫是一种寄生虫,可以感染人类和动物的胰腺,引起胰腺炎等疾病。
胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒包含以下主要成分:
PCR反应液:包括DNA聚合酶、dNTPs、引物等。
模板DNA提取液:用于提取样本中的DNA。
阳性对照品:含有胰阔圆盘吸虫特异性基因序列的DNA片段。
阴性对照品:不含有胰阔圆盘吸虫特异性基因序列的DNA片段。
胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒
胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒的操作步骤如下:
1.样本采集:从患者体内采集血液、粪便、组织等样本,并将其保存在无菌容器中。
2.DNA提取:将采集到的样本进行DNA提取,通常采用柱式或磁珠式DNA提取试剂盒。提取后的DNA应保存在-20°C或更低的温度下。
3.PCR反应体系准备:根据试剂盒说明书的要求,配制PCR反应体系,包括引物、荧光探针、dNTPs、DNA聚合酶等。
4.PCR反应:将提取的DNA加入到PCR反应体系中,进行PCR反应。反应条件和时间根据试剂盒说明书的要求进行设置。
5.结果分析:将PCR反应后的产物进行荧光信号检测,根据荧光信号的出现情况判断是否存在胰阔圆盘吸虫的感染。
胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒的优点是灵敏度高、特异性强,可以快速准确地检测出胰阔圆盘吸虫的存在。同时,该试剂盒操作简单,不需要复杂的设备和技术,适用于各种实验室条件。
应用[4-5]
胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒可以用于胰阔盘吸虫分子种系发生的研究
胰阔盘吸虫(Eurytrema pancreaticum)主要寄生于牛、羊等反刍动物的胰脏、胰管内,破坏动物的胰腺或阻塞胰管,引起胰阔盘吸虫病。动物感染后会出现消瘦、贫血、水肿及消化功能障碍,导致生产性能下降,严重感染者会引起死亡。胰阔盘吸虫病呈全球分布,对反刍动物危害严重,给畜牧业生产造成较大的经济损失。另外,胰阔盘吸虫还可寄生于人,是一种重要的人兽共患病病原。目前对胰阔盘吸虫的研究主要集中在虫体形态结构、发育过程及胰阔盘吸虫病的流行病学、诊断和综合防治等传统寄生虫学方面;在胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒分子水平上仅对核糖体18S和小RNA进行了研究,对核糖体全序列和线粒体全基因组的研究还未见报道。因此,本研究针对这一空白展开研究。
首先,利用胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒分子生物学方法,获得5条胰阔盘吸虫的核糖体全序列,对5个核糖体全序列的大小、基因组成、碱基组成等进行分析,并基于18S核糖体序列构建系统发生树,分析胰阔盘吸虫与其他吸虫间的进化关系。其次,扩增胰阔盘吸虫的线粒体全基因组,对全基因组进行序列分析,构建系统发生树,探讨胰阔盘吸虫在吸虫中的系统发生位置。
胰阔圆盘吸虫PCR试剂盒结果表明:扩增获得的5个核糖体全序列长度为83068310bp,包括18S,ITS1,5.8S,ITS2,28S和IGS。5条虫体18S、ITS1、5.8S、ITS2、28S的长度均无变化,分别为1996bp、1103bp、160bp、231bp和3669bp,IGS长度只有四个碱基的变化,为11471151bp。比较发现6段核糖体序列的种内差异分别为0.10.4%、00.5%、0%、0%、00.2%和2.920.2%。以18S核糖体序列为标记基因,采用MP、ML和BI三种方法构建系统发生树的结果相似,胰阔盘吸虫位于斜睾目的进化分支上,与传统形态学分类一致,说明18S核糖体序列是研究寄生虫分子种系发生的良好基因标记。所获得的线粒体全基因组由12个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和2个非编码区组成,线粒体全基因组大小为15169bp,编码蛋白质基因、rRNA基因和非编码区序列长分别为10121bp,1746bp和1281bp。整个线粒体基因组核苷酸组成为:A=17.96%,C=11.13%,G=26.21%,T=44.52%,A+T占62.48%,基因组碱基组成明显偏好碱基A和T。
参考文献
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