BLR是 RecA（重组酶A缺陷）型菌株，来源于BL21.该菌株提升了质粒单体的产量，这有助于提升含有重复序列的质粒的稳定性，也能提高能够导致DE3噬菌体丢失的质粒的稳定性。BLR菌株同时是lon和ompt蛋白酶缺陷型菌株。

DE3是溶源性的 λDE3, 所以带有T7 RNA聚合酶的染色体拷贝。该菌株适用于pET系列载体，及其他T7启动子系列载体。

含有pLSs质粒，pLySs质粒能够产生T7溶菌酶，可以有效降低目的基因的基础表达水平。pLySs质粒使得该菌株具有氯霉素抗性。pLySs质粒的起始复制位点是p15 Origin, 这使得该质粒能够和pUC-及pBR322-衍生的质粒互相共存。