pTNF-α-promoter-TA-luc (报告基因质粒)
pTNF-α-promoter-TA-luc(报告基因质粒)是信裕生物自行研发的用于检测TNF-α promoter转录活性水平的报告基因质粒。
pTNF-α-promoter-TA-luc是以信裕生物的pGL6-TA质粒为模板,在其多克隆位点插入了human TNF-α的启动子序列(-991bp~-1bp),可以高灵敏度地检测human TNF-α promoter的激活水平。
TNF-α(Tumor Necrosis Factor α),中文名为肿瘤坏死因子α,是一种非常重要的炎性细胞因子,在炎性疾病的发生发展过程中起重要作用,常作为炎症反应的重要指标。
pGL6-TA是用于在哺乳动物细胞中进行萤火虫萤光素酶(firefly luciferase)报告基因检测的新一代质粒。该报告基因质粒比
Promega公司的pGL3系列有了全面的改进,一方面对于luciferase的编码进行了改进,确保能更好地在哺乳动物细胞中进行表达,同时对整个质粒中所有可以被预测出的可能的转录因子结合位点全部进行了适当的突变处理,在保持原有功能不变的情况下,使各种转录因子在质粒上的非特异性结合降到最低。
萤光素、萤光素酶、萤火虫萤光素酶和海肾萤光素酶也经常被称作荧光素、荧光素酶、萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶。
pTNF-α-promoter-TA-luc质粒的主要信息如下:
Minimal TA promoter(pTA)
1033-1055
luc2 reporter gene
1097-2749
SV40 late poly(A)signal
2784-3005
SV40 early enhancer/promoter
3053-3471
Synthetic neomycin phosphotransferase(Neor) coding region
3496-4290
Synthetic poly(A)signal
4315-4363
Reporter Vector primer 4(RVprimer4)binding region
4430-4449
ColE1-derived plasmid replication origin
4687
Synthetic Beta-lactamase(Ampr)coding region
5451-6348
Synthetic poly(A)signal/transcriptional pause site
6443-6596
Reporter Vector primer 3(RVprimer3)binding region
6545-6564
pTNF-α-promoter-TA-luc质粒的图谱如下:
pTNF-α-promoter-TA-luc的多克隆位点及TNF-α promoter的详细图谱如下:
1
GGCCTAACTG
GCTCCTGGGA
GATATGGCCA
CCGGATTGAC
CGAGGACCCT
CTATACCGGT
51
CTCTGAGGAA
TGGGTTACAG
GAGACCTCTG
GGGAGATGTG
GAGACTCCTT
ACCCAATGTC
CTCTGGAGAC
CCCTCTACAC
101
TGGGTAGGAG
AATGTCCAGG
GCTATGGAAG
TCGAGTATGG
ACCCATCCTC
TTACAGGTCC
CGATACCTTC
AGCTCATACC
151
TTAACGAAGA
CAGGGCCATG
TAGAGGGCCC
CAGGGAGTGA
AATTGCTTCT
GTCCCGGTAC
ATCTCCCGGG
GTCCCTCACT
201
AGGACCTCCA
GGTATGGAAT
ACAGGGGACG
TTTAAGAAGA
TCCTGGAGGT
CCATACCTTA
TGTCCCCTGC
AAATTCTTCT
251
CACTGGGGCC
CTGAGAAGTG
AGAGCTTCAT
GAAAAAAATC
GTGACCCCGG
GACTCTTCAC
TCTCGAAGTA
CTTTTTTTAG
301
GAGTTCCTTG
GAAGCCAAGA
CTGAAACCAG
CATTATGAGT
CTCAAGGAAC
CTTCGGTTCT
GACTTTGGTC
GTAATACTCA
351
GAATGAAAGA
AGAAGGCCTG
CCCCAGTGGG
GTCTGTGAAT
CTTACTTTCT
TCTTCCGGAC
GGGGTCACCC
CAGACACTTA
401
GATTTCACTC
CCCGGGGCTG
TCCCAGGCTT
GTCCCTGCTA
CTAAAGTGAG
GGGCCCCGAC
AGGGTCCGAA
CAGGGACGAT
451
GCCTTTCCTG
AGGCCTCAAG
CCTGCCACCA
AGCCCCCAGC
CGGAAAGGAC
TCCGGAGTTC
GGACGGTGGT
TCGGGGGTCG
501
CGCAGGGACC
CAAACACAGG
CCTCAGGACT
CAACACAGCT
GCGTCCCTGG
GTTTGTGTCC
GGAGTCCTGA
GTTGTGTCGA
551
ACCCCGTTTT
CTCTCCCTCA
AGGACTCAGC
TTTCTGAAGC
TGGGGCAAAA
GAGAGGGAGT
TCCTGAGTCG
AAAGACTTCG
601
TCTAGTTCTA
TCTTTTTCCT
GCATCCTGTC
TGGAAGTTAG
AGATCAAGAT
AGAAAAAGGA
CGTAGGACAG
ACCTTCAATC
651
GCCACAGACC
TGGTCCCCAA
AAGAAATGGA
GGCAATAGGT
CGGTGTCTGG
ACCAGGGGTT
TTCTTTACCT
CCGTTATCCA
701
ATGGGGACGG
GGTTCAGCCT
CCAGGGTCCT
ACACACAAAT
TACCCCTGCC
CCAAGTCGGA
GGTCCCAGGA
TGTGTGTTTA
751
CCCAGAAGAC
CCCCCTCGGA
ATCGGAGCAG
GGAGGATGGG
GGGTCTTCTG
GGGGGAGCCT
TAGCCTCGTC
CCTCCTACCC
801
GGTATCCTTG
ATGCTTGTGT
GTCCCCAACT
TTCCAAATCC
CCATAGGAAC
TACGAACACA
CAGGGGTTGA
AAGGTTTAGG
851
GATGGAGAAG
AAACCGAGAC
AGAAGGTGCA
GGGCCCACTA
CTACCTCTTC
TTTGGCTCTG
TCTTCCACGT
CCCGGGTGAT
901
CAGATGAGCT
CATGGGTTTC
TCCACCAAGG
AAGTTTTCCG
GTCTACTCGA
GTACCCAAAG
AGGTGGTTCC
TTCAAAAGGC
951
GATTCTTTCC
CCGCCCTCCT
CTCGCCCCAG
GGACATATAA
CTAAGAAAGG
GGCGGGAGGA
GAGCGGGGTC
CCTGTATATT
-1 BglII HindIII Minimal TA promoter
1001
AGATCTGCAG
AAGCTTAGAC
1051
CCAGCTTGGC
AATCCGGTAC
TGTTGGTAAA
GCCACCATGG
GGTCGAACCG
TTAGGCCATG
ACAACCATTT
CGGTGGTACC
pTNF-α-promoter-TA-luc中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pTNF-α-promoter-TA-luc)包括:
Aat II
Afl II
Asc I
Ase I
BsaA I
BsiW I
BspM II
BssH II
Eco72 I
EcoR V
Mlu I
Nde I
Nhe I
Nru I
PaeR7 I
Pme I
Pml I
Psp1406 I
Rsr II
SnaB I
Spl I
pTNF-α-promoter-TA-luc中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pTNF-α-promoter-TA-luc once)包括:
Sfi I
GGCCN,NNN`NGGCC
9
EcoN I
CCTNN`N,NNAGG
3971
Bgl I
GCCN,NNN`NGGC
9
BsiC I
TT`CG,AA
4366
Acc65 I
G`GTAC,C
15
BstB I
TT`CG,AA
4366
Asp718
G`GTAC,C
15
Sal I
G`TCGA,C
4380
Kpn I
G,GTAC`C
19
ApaL I
G`TGCA,C
4944
Bsa I
GGTCTC 7/11
66
HgiE II
ACCNNNNNNGGT
-1/135209
EcoR I
G`AATT,C
388
Not I
GC`GGCC,GC
5450
Tth111 I
GACN`N,NGTC
661
BstE II
G`GTNAC,C
5477
Sac I
G,AGCT`C
911
Ahd I
GACNN,N`NNGTC
5552
Bgl II
A`GATC,T
1012
Pvu I
CG,AT`CG
5922
Hind III
A`AGCT,T
1022
Sac II
CC,GC`GG
5946
BsrG I
T`GTAC,A
1588
Bst1107 I
GTA|TAC
6062
Dra III
CAC,NNN`GTG
2244
Xca I
GTA|TAC
6062
Mun I
C`AATT,G
2924
Spe I
A`CTAG,T
6381
BamH I
G`GATC,C
3017
BsmB I
CGTCTC 7/11
6394
pTNF-α-promoter-TA-luc质粒中推荐使用的测序引物序列如下:
RVprimer3(6545-6564):
CTA GCA AAA TAG GCT GTC CC
pTNF-α-promoter-TA-luc的全序列信息: D2481 pTNF-α-promoter-TA-luc-seq.txt
包装清单:
KL-2481-1μg
pTNF-α-promoter-TA-luc (报告基因质粒)
1μg
KL-2481-100μg
pTNF-α-promoter-TA-luc (报告基因质粒)
100μg
保存条件:
-20℃保存。
注意事项:
本质粒未经信裕生物书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。使用说明:
1. 首次使用1μg包装的本产品时,请先取少量本质粒转化大肠杆菌,进行质粒小量、中量或大量抽提后再用于后续用途。抽提获得的质粒可以通过酶切电泳进行鉴定,或通过测序进行鉴定。
2. 100μg包装的本产品质粒浓度为0.1μg/μl,共1ml。可以直接用于酶切或者转染细胞。
3. pTNF-α-promoter-TA-luc可以用常规的细胞转染方法转染细胞。检测时可以采用信裕生物的萤火虫萤光素酶报告基因检测试剂盒(RG005/RG006)或双萤光素酶报告基因检测试剂盒(RG027/RG028)。
4. LPS等是常见的可以激活TNF-α转录的试剂,可以用作pTNF-α-promoter-TA-luc报告基因检测时的阳性对照。