pCMV-C-DsRed是信裕生物自行研发的哺乳动物细胞表达质粒,用于表达C端含DsRed (Discosoma sp. red fluorescent protein,香菇珊瑚红色荧光蛋白)标签的融合蛋白。该质粒含有CMV启动子,可以高效启动目的蛋白在细胞中的表达。在多克隆位点的后面有一个DsRed的完整编码序列,因此在多克隆位点根据阅读框插入目的基因就可以表达C端含有DsRed标签的融合蛋白。利用DsRed的荧光特性可以比较容易地观察融合蛋白的表达水平和细胞内定位,也可以利用DsRed抗体来检测或免疫沉淀融合蛋白。DsRed与GFP没有序列同源性,不能使用GFP抗体检测DsRed。该质粒为卡那霉素抗性。转染细胞后,可使用G418筛选稳定表达目的蛋白的细胞株。
pCMV-C-DsRed质粒的主要信息如下:
▼
▲
Feature Nucleotide
Position
CMV promoter
1-602
T3 promoter and T3 primer binding site
620-639
Multiple cloning site
651-740
DsRed
741-1419
T7 promoter and T7 primer binding site
1478-1499
SV40 polyA signal
1511-1894
f1 origin of ss-DNA replication
2032-2338
bla promoter
2363-2487
SV40 promoter
2507-2845
Neomycin/kanamycin resistance ORF
2869-3661
HSV-thymidine kinase (TK) polyA signal
3662-4130
pUC origin
4259-4926
pCMV-C-DsRed质粒(4969bp)的图谱如下:
pCMV-C-DsRed的多克隆位点的详细图谱如下:
▼
▲
SmaI
SacI SacII NotI XmaI BamHI HindIII
651
GAGCTCCACC
GCGGTGGCGG
CCGCTCTAGC
CCGGGCGGAT
CCAAGCTTCT
CTCGAGGTGG
CGCCACCGCC
GGCGAGATCG
GGCCCGCCTA
GGTTCGAAGA
EcoRI EcoRV SalI XhoI XbaI DsRed
701
GCAGGAATTC
GATATCGTCG
ACAGATCTCT
CGAGTCTAGA
ATGGACAACA
CGTCCTTAAG
CTATAGCAGC
TGTCTAGAGA
GCTCAGATCT
TACCTGTTGT
751
CCGAGGACGT
CATCAAGGAG
TTCATGCAGT
TCAAGGTGCG
CATGGAGGGC
GGCTCCTGCA
GTAGTTCCTC
AAGTACGTCA
AGTTCCACGC
GTACCTCCCG
801
TCCGTGAACG
GCCACTACTT
CGAGATCGAG
GGCGAGGGCG
AGGGCAAGCC
AGGCACTTGC
CGGTGATGAA
GCTCTAGCTC
CCGCTCCCGC
TCCCGTTCGG
851
CTACGAGGGC
ACCCAGACCG
CCAAGCTGCA
GGTGACCAAG
GGCGGCCCCC
GATGCTCCCG
TGGGTCTGGC
GGTTCGACGT
CCACTGGTTC
CCGCCGGGGG
901
TGCCCTTCGC
CTGGGACATC
CTGTCCCCCC
AGTTCCAGTA
CGGCTCCAAG
ACGGGAAGCG
GACCCTGTAG
GACAGGGGGG
TCAAGGTCAT
GCCGAGGTTC
951
GCCTACGTGA
AGCACCCCGC
CGACATCCCC
GACTACATGA
AGCTGTCCTT
CGGATGCACT
TCGTGGGGCG
GCTGTAGGGG
CTGATGTACT
TCGACAGGAA
1001
CCCCGAGGGC
TTCACCTGGG
AGCGCTCCAT
GAACTTCGAG
GACGGCGGCG
GGGGCTCCCG
AAGTGGACCC
TCGCGAGGTA
CTTGAAGCTC
CTGCCGCCGC
1051
TGGTGGAGGT
GCAGCAGGAC
TCCTCCCTGC
AGGACGGCAC
CTTCATCTAC
ACCACCTCCA
CGTCGTCCTG
AGGAGGGACG
TCCTGCCGTG
GAAGTAGATG
1101
AAGGTGAAGT
TCAAGGGCGT
GAACTTCCCC
GCCGACGGCC
CCGTAATGCA
TTCCACTTCA
AGTTCCCGCA
CTTGAAGGGG
CGGCTGCCGG
GGCATTACGT
1151
GAAGAAGACT
GCCGGCTGGG
AGCCCTCCAC
CGAGAAGCTG
TACCCCCAGG
CTTCTTCTGA
CGGCCGACCC
TCGGGAGGTG
GCTCTTCGAC
ATGGGGGTCC
1201
ACGGCGTGCT
GAAGGGCGAG
ATCTCCCACG
CCCTGAAGCT
GAAGGACGGC
TGCCGCACGA
CTTCCCGCTC
TAGAGGGTGC
GGGACTTCGA
CTTCCTGCCG
1251
GGCCACTACA
CCTGCGACTT
CAAGACCGTG
TACAAGGCCA
AGAAGCCCGT
CCGGTGATGT
GGACGCTGAA
GTTCTGGCAC
ATGTTCCGGT
TCTTCGGGCA
1301
GCAGCTGCCC
GGCAACCACT
ACGTGGACTC
CAAGCTGGAC
ATCACCAACC
CGTCGACGGG
CCGTTGGTGA
TGCACCTGAG
GTTCGACCTG
TAGTGGTTGG
1351
ACAACGAGGA
CTACACCGTG
GTGGAGCAGT
ACGAGCACGC
CGAGGCCCGC
TGTTGCTCCT
GATGTGGCAC
CACCTCGTCA
TGCTCGTGCG
GCTCCGGGCG
ApaI
1401
CACTCCGGCT
▼
▲
CCCAGTAGA
G
GGCCCGGTAC
CTTAATTAAT
TAAGGTACCA
GTGAGGCCGA
▼
▲
GGGTCATCT
C
CCGGGCCATG
GAATTAATTA
ATTCCATGGT
pCMV-C-DsRed中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pCMV-C-DsRed)包括:
▼
▲
AclI
AflII
AgeI
AscI
AsiSI
BaeI
BbvCI
BcgI
BlpI
BmgBI
Bpu10I
BsiWI
BsmBI
BspEI
BspQI
BssHII
BstZ17I
EarI
EcoNI
FseI
NruI
PmeI
PmlI
PpuMI
PshAI
PspXI
SapI
ScaI
SgrAI
SpeI
SwaI
XcmI
XmnI
pCMV-C-DsRed中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pCMV-C-DsRed once)包括:
▼
▲
NdeI
CA`TA,TG
240
BbsI
GAAGACNN`NNNN,
1161
SnaBI
TAC|GTA
346
BsrGI
T`GTAC,A
1279
CspCI
,NN`(N)11CAA(N)5GTGG(N)10,NN`
380
PflMI
CCAN,NNN`NTGG
1319
NheI
G`CTAG,C
597
PspOMI
G`GGCC,C
1420
BmtI
G,CTAG`C
597
ApaI
G,GGCC`C
1420
SacI
G,AGCT`C
651
PvuI
GCAGTG,NN`
1500
Eco53kI
GAG|CTC
653
BclI
T`GATC,A
1656
BstXI
CCAN,NNNN`NTGG
659
MfeI
C`AATT,G
1749
SacII
CC,GC`GG
660
HpaI
GTT|AAC
1762
NotI
GC`GGCC,GC
668
BtsI
GCAGTG,NN`
1836
TspMI
C`CCGG,G
680
MluI
A`CGCG,T
1885
XmaI
C`CCGG,G
680
SfiI
GGCCN,NNN`NGGCC
2771
SmaI
CCC|GGG
682
ClaI
AT`CG,AT
2839
SrfI
GCCC|GGGC
682
BspDI
AT`CG,AT
2839
BamHI
G`GATC,C
687
KasI
G`GCGC,C
2998
HindIII
A`AGCT,T
693
NarI
GG`CG,CC
2999
EcoRI
G`AATT,C
705
PluTI
G,GCGC`C
2998
EcoRV
GAT|ATC
713
SfoI
GGC|GCC
3000
SalI
G`TCGA,C
717
MscI
TGG|CCA
3081
AccI
GT`MK,AC
718
Tth111I
GACN`N,NGTC
3117
XhoI
C`TCGA,G
729
PflFI
GACN`N,NGTC
3117
PaeR7I
C`TCGA,G
729
BsrDI
GCAATG,NN`
3230
XbaI
T`CTAG,A
735
RsrII
CG`GWC,CG
3515
BstEII
G`GTNAC,C
881
BstBI
TT`CG,AA
3681
AhdI
GACNN,N`NNGTC
919
BsaI
GGTCTCN`NNNN,
3988
AfeI
AGC|GCT
1023
ApaLI
G`TGCA,C
4603
SbfI
CC,TGCA`GG
1077
PciI
A`CATG,T
4917
pCMV-C-DsRed质粒中推荐使用的测序引物序列如下:
T3 primer (620-639): 5′-AATTAACCCTCACTAAAGGG-3′
C-DsRed primer (852-873): 5′- TGGCGGTCTGGGTGCCCTCGTA -3′
pCMV-C-DsRed的全序列信息:D2624 pCMV-C-DsRed-seq.txt
pCMV-C-DsRed质粒转染细胞后的表达效果请参考图1。