pGL6-miR (报告基因质粒)
pGL6-miR (报告基因质粒)是信裕生物自行研发的一种用于microRNA(miRNA)等研究的萤光素酶报告基因质粒。该质粒可用于把目的基因的3'非翻译区(3'-untranslated region, 3'-UTR)或其它适当序列插入到其多克隆位点,然后在哺乳动物细胞中高灵敏度地检测特定microRNA(miRNA)或其它非编码RNA等对该基因3'-UTR或其它靶序列调控活性的报告基因质粒。
萤光素、萤光素酶、萤火虫萤光素酶和海肾萤光素酶也经常被称作荧光素、荧光素酶、萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶。
pGL6-miR以信裕生物的pGL6质粒为模板,具有氨苄青霉素抗性,并在萤火虫萤光素酶基因之后添加了多克隆位点,便于插入目的基因的3'-UTR或其它适当的靶序列。
pGL6-miR的主要工作原理是,把目的基因的3'非翻译区(3'-untranslated region, 3'-UTR)或其它适当序列插入到萤光素酶基因(luc2)的下游,转染细胞并检测萤光素酶的表达。如果细胞内源或外源表达的miRNA与靶序列结合,通常会抑制萤光素酶的翻译或促进mRNA的降解,从而使萤光素酶的表达量减少。因此通过本报告基因质粒检测萤光素酶的表达水平,可以检测内源或外源表达的miRNA是否对插入的靶序列有调控作用。并且可以通过靶序列中预测的miRNA结合位点的突变,用于比较突变前后萤光素酶表达水平的变化。如果预测的miRNA位点突变后,miRNA的调控作用消失,则基本上说明突变的位点就是miRNA在靶序列中具体的结合位点。
pGL6-miR带有中低等强度的PGK启动子,有利于检测miRNA等对于萤火虫萤光素酶表达水平的下调作用,即当miRNA的抑制作用较弱时也能检测到。并且PGK启动子可以在人、大鼠、小鼠甚至酵母细胞中都可以发挥作用。
pGL6-miR质粒的主要信息如下:
Feature Nucleotide
Position
luc2 reporter gene
549-2202
Multiple cloning region
2208-2261
SV40 late poly(A) sinal
2268-2512
SV40 early enhancer/promoter
2554-2972
Synthetic neomycin phosphotransferase(Neor)coding region
2998-3792
Synthetic poly(A) signal
3817-3865
Synthetic Beta-lactamase(Ampr) coding region
4980-5840
Synthetic poly(A) signal/transcriptional pause site
5945-6097
pGL6-miR质粒图谱如下:
pGL6-miR质粒的多克隆位点的详细图谱如下(请特别注意其中的NheI不是单酶切位点):
2169
AGGCCAAGAA
GGGCGGCAAG
ATCGCCGTGT
TCCGGTTCTT
CCCGCCGTTC
TAGCGGCACA
BamHI EcoRV XhoI SacI MluI BglII HindIII
2220
GGATCCGATA
TCCTCGAGGA
GCTCACGCGT
AGATCTAAGC
CCTAGGCTAT
AGGAGCTCCT
CGAGTGCGCA
TCTAGATTCG
pGL6-miR中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pGL6-miR)包括:
Aat II
Afl II
Asc I
Ase I
Bsa I
BsaA I
BsiW I
BssH II
Eco72 I
EcoR I
Nde I
Nru I
PflM I
Pme I
Pml I
Psp1406 I
PspA I
Rsr II
Sam I
SnaB I
Spl I
Srf I
Tth111 I
Vsp I
Xcm I
pGL6-miR中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pGL6-miR once)包括:
Sfi I
GGCCN,NNN`NGGCC
9
Sal I
G`TCGA,C
3881
BspM II
T`CCGG,A
445
EcoN I
CCTNN`N,NNAGG
3472
BsaB I
GATNN|NNATC
997
Xba I
T`CTAG,A
3796
BsrG I
T`GTAC,A
1040
BsiC I
TT`CG,AA
3867
Dra III
CAC,NNN`GTG
1696
BstB I
TT`CG,AA
3867
Acc65 I
G`GTAC,C
2209
ApaL I
G`TGCA,C
4445
Asp718
G`GTAC,C
2209
Ple I
GAGTC 9/10
4510
Kpn I
G,GTAC`C
2213
HgiE II
ACCNNNNNNGGT -1/13
4710
BamH I
G`GATC,C
2221
Not I
GC`GGCC,GC
4951
EcoR V
GAT|ATC
2229
BstX I
CCAN,NNNN`NTGG
4975
PaeR7 I
C`TCGA,G
2233
Pst I
C,TGCA`G
4975
Xho I
C`TCGA,G
2233
BstE II
G`GTNAC,C
4978
Sac I
G,AGCT`C
243
Ahd I
GACNN,N`NNGTC
5053
Mlu I
A`CGCG,T
2245
Bsu36 I
CC`TNA,GG
5409
Bgl II
A`GATC,T
2251
Pvu I
CG,AT`CG
5423
HinD III
A`AGCT,T
2257
Sac II
CC,GC`GG
5447
Apo I
R`AATT,Y
2361
Bst1107 I
GTA|TAC
5563
Mun I
C`AATT,G
2425
Xca I
GTA|TAC
5563
pGL6-miR质粒中推荐使用的测序引物序列如下:
Forward primer (2135-2154): 5′GTTGGACGCCCGCAAGATCC 3′
Reverse primer (2303-2322): 5′GGTTTGTCCAAACTCATCAA 3′
pGL6-miR的全序列信息:D2106 pGL6-miR-seq.txt
包装清单:
KL-2106-1μg
pGL6-miR (报告基因质粒)
1μg
KL-2106-100μg
pGL6-miR (报告基因质粒)
100μg
保存条件:
-20℃保存。
注意事项:
本质粒未经信裕生物书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。