T4 DNA Ligase即T4 DNA连接酶,可以催化粘端或平端双链DNA或RNA的5'-P末端和3'-OH末端之间以磷酸二酯键结合,该催化反应需ATP作为辅助因子。同时T4 DNA 连接酶可以修补双链DNA、双链RNA或DNA/RNA杂合物上的单链缺刻(single-strand nicks)。 用途:T4 DNA Ligase常用于DNA片段和载体、linker或adaptor等的连接。也可以用于缺刻修复及Ligase介导的RNA检测。 来源:本T4 DNA Ligase由大肠杆菌表达,表达基因的来源为T4嗜菌体。 活性定义:One unit is defined as the amount of enzyme required to give 50% ligation of HindIII fragments of lambda DNA in 30 min at 16℃ in 20 μl of the assay mixture containing 50 mM Tris, pH 7.5, 10 mM MgCl2, 10 mM DTT, 1 mM ATP, 25 μg/ml BSA and a 5'-DNA termini concentration of 0.12 μM (300 μg/ml)。200U等于1个Weiss unit,以Weiss unit计,本产品共200单位。
T4 DNA Ligase连接产物转化感受态后涂板LB平板的效果参考图1。
图1. 本T4 DNA Ligase的连接产物转化感受态细菌后涂板获得的LB平板效果图。A. 双酶切后的载体纯度:不含DNA内切酶、外切酶和磷酸酯酶,不含RNA酶,满足常规连接反应要求。 酶储存溶液:20 mM Tris, pH 7.5, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA and 50% (v/v) glycerol。 10X Ligation Buffer:400 mM Tris, pH 7.8, 100 mM MgCl2, 100 mM DTT, 5 mM ATP。 失活或抑制:65℃孵育10分钟可以导致T4 DNA Ligase失活;NaCl或KCl浓度大于200mM时强烈抑制T4 DNA Ligase。
包装清单:
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产品编号
产品名称
包装
XY-7006-1
T4 DNA Ligase (1000U/μl)
40, 000U
XY-7006-2
10X Ligation Buffer
0.3ml
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说明书
1份
保存条件:
-20℃保存。 注意事项:
对于普通的转化大肠杆菌的操作,不必对连接产物进行纯化,连接产物可以直接用于转化。但用电转方法转化大肠杆菌时,通常宜先用DNA纯化试剂盒或酚氯仿抽提方法等纯化DNA,然后再进行电转。
需进行平端连接或快速连接时,推荐使用信裕生物的快速DNA连接试剂盒(D7002/D7003)。T4 DNA Ligase可以进行平端连接,但效率较低。
普通连接反应不必进行凝胶电泳观察。如果需要对于连接产物进行凝胶电泳观察,推荐先在65℃孵育10分钟使
T4 DNA Ligase失活,以避免T4 DNA Ligase和DNA结合导致的条带位置迁移(band shift)。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。则可以取连接过夜的剩余连接产物再次转化大肠杆菌。
e. 随后即可直接取连接产物用于转化感受态细菌。 3. Linker或RNAi片段和载体的连接:
a. 载体的酶切和纯化同步骤1a和1b。
b. Linker或RNAi片段的退火可以选择适当的DNA退火缓冲液,例如信裕生物的
Annealing Buffer for DNA Oligos(5X)(D0251), 进行退火反应。
c. 长度大于8bp的Linker或退火的RNAi片段,可以按照5:1至10:1的比例和载体进行连接反应。例如载体为0.03pmol,则插入片
段可以为0.15至0.3pmol。长度小于8bp的linker,比例需调整为10:1以上。
d. 除插入片段的用量外,随后按照步骤1e-1h进行。 4. DNA自身环化的连接:
参考步骤1e,待插入片段换成适量的水即可。其余步骤按照步骤1f-1h进行。 5. 其它类型的DNA片段连接参考上述方法进行。
常见问题: 1. 连接反应后转化效率很低或阳性克隆非常少:
a. 可能感受态细菌转化效率太低,用质粒作为阳性对照同时检测感受态的转化效率。
b. 可以尝试提高载体或插入片段的纯度。对于平端连接需注意适当延长连接时间。
c. 可能载体酶切不够充分,用未经连接的载体转化作为阴性对照。
d. 用存放DNA的溶液进行转化,作为阴性对照,检测感受态细菌是否存在问题。