一步式染料法qRT-PCR试剂盒
产品及特点 本产品是基于荧光染料检测的即用型 RT-PCR 试剂盒,可以对靶 RNA 分子进行实时定量 RT-PCR 分析(quantitative RT-PCR、qRT-PCR)。产品含有经过优化的缓冲液组分、逆转 录酶、热启动 Taq DNA 聚合酶、Taq DNA 稳定剂、dNTPs、MgCl2和稳定剂等所有实时定 量 RT-PCR 所需要的成分,用户只需加入 RNA 模板和引物即可进行染料法实时定量 RT-PCR 反应,具有广泛的用途。
本产品具有下列特点: 1. 以 2×Mix 提供,用户只需准备模板、引物和 ROX 染料(取决于 qPCR 仪器)即可以进 行染料法实时定量 RT-PCR 实验,非常方便快捷,降低了操作误差。 2. 各成分的浓度和比例都经过精心优化,反应的灵敏度高,特异性强。灵敏度最高时可以达 到 50 拷贝/反应(跟模板质量,引物设计等相关)。 3. 灵敏度和专一性比常规 RT-PCR 更高。 4. 可用于基因表达分析、SNP 分析、拷贝数分析等实验。也可以用于定性检测。 5. 本产品只能用于科研,1mL 足够 100 次 20uL 体系的染料法 qRT-PCR 反应。 规格及成分 成 份 编 号 塑料袋包装 2×染料法 qRT-PCR 缓冲液 190102a 500 uL(橙色盖) 10×染料法 qRT-PCR 酶混合液 190102b 100 uL(红色盖) 使用手册 190102sc 1 份
运输及保存 低温运输,-20℃保存, 不冻融时保存期限为 12 个月。如果需要每天使用,可在 4℃放置三周。
自备试剂 RNA 模板、引物、超纯水。
使用方法 1. 如果有 N 个样品并且做定量分析,设置 N+7 个反应,多出的 7 个中,6 个是做标准 曲线的阳性对照,一个是阴性对照(NC)。在 N+7 个 PCR 管中,加入下列成分。如果是 做定性分析,则 6 个做标准曲线的样品缩减成一个阳性对照(PC),用户自己需要根据下 表进行适当修改(把 6 个标曲反应改成 1 个阳性对照反应)。 成分 N 个 样品管 6 个标准 曲线管 NC 管 2×染料法 qRT-PCR 缓冲液 各 10 uL 各 10 uL 10 uL 自备引物 1(10uM) 各 1 uL 各 1 uL 1 uL 自备引物 2(10uM) 各 1 uL 各 1 uL 1 uL N 个自备模板 RNA 各 1-2 uL 不加 不加 自备阳性对照模板(6 个梯度) 不加 各 1 uL(1 管 加 1 个梯度) 不加 阴性对照模板(水) 不加 不加 1 uL 自备 50×ROX I 染料 或 自备 50×ROX II 染料(见注) 各 0.4 uL 各 0.4 uL 0.4 uL 10×染料法 qRT-PCR 酶混合液 2 uL 2 uL 2 uL 补超纯水到 20 uL 20 uL 20 uL 注,下列信息仅供参考,具体以 qPCR 仪器的使用手册为准。 1、不需要 ROX 的机型:Agilent MX3000 和 MX4000、iCycler IQ、LightCycler 480、,、 Smart Cycler System、Thermal Cycler Dice Real Time System 等型号的荧光 PCR 仪器 不需要加 ROX 染料,但加入的话也不会影响整个 PCR 分析。 2、需要使用 ROX I 的机型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step One、Step One Plus。 3、需要使用 ROX II 的机型:ABI Prism7500、7500 Fast、MJ Opticon、MJ Chromo4、 Corbett RotorGene 3000。
2. 放入荧光 PCR 仪中进行扩增, 下表的扩增参数仅供参考,一定需要根据靶分子长度,引物 的 Tm 值等进行调节。一般选择三步法 PCR: 步骤 反应参数 备注 逆转录(RT 步骤) 94℃ 30 分钟 预变性 94℃ 2 分钟 PCR(35-45 次循环) 94℃ 15 秒 55-65℃ 15-30 秒 在此步采集 FAM 通道的 荧光信号 72℃ 30 秒 如果引物 Tm 值接近 60℃,也可以选择两步法 PCR: 步骤 反应参数 备注 逆转录(RT 步骤) 94℃ 30 分钟 预变性 94℃ 2 分钟 PCR(35-45 次循环) 94℃ 15 秒 60℃ 30-60 秒 在此步采集 FAM 通道的 荧光信号
3. 数据处理 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘 制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 DNA 浓度的 log 值,再推算 出其浓度。 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性。一般情况下,阴性对照 Ct 大于或等 于 40(阈值需要以阴性对照的 Ct 值确定,此处为便于叙述以 40 为例,具体情况很可能 阈值不一样)。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 30。 对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性,如果小于或等于 35 则为阳性。如果在 35-40 之间,则重复一次。重复实验的 Ct 值如果大于或等于 40 则为阴性,如果小于 40, 则为阳性。
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