由于miRNA(microRNA)分子序列较小,仅20nt左右,没有真核生物特有的Poly(A)尾巴结构,采用传统Oligo dT引物和随机引物很难获得从miRNA到cDNA的反转录产物。目前普遍采用的解决方案有两种:特异性反转录引物(下图A所示)、两步加A法反转录方案(下图B所示)。Biorab公司开发出一套全新的一步法miRNA反转录试剂盒,可以对成熟的miRNA同时完成Poly(A)反应和反转录反应,直接获得含有特异性tag和15(T)的cDNA产物(下图C所示)。该方法使得miRNA反转录与mRNA的反转录一样轻松,直接将提取的microRNA与反应缓冲液混合物混合并置于PCR仪上1小时即可获得高浓度的、包含所有miRNA分子的cDNA产物,获得的cDNA产物适合于采用SYBR Green染料法进行RealTime PCR进行定量检测。
产品组成:
组分
MT0005A(25T)
MT0005B(100T)
4×One step miRNA RT Solution
125μl
500μl
10×miRNA RT Primer
50μl
200μl
储存:请置于-20℃,可保存2年,避免反复冻融。
注:如4×One step miRNA RT Solution出现沉淀属正常现象,可用手捂化,混合均匀后使用不影响实验结果。
特别说明: 10×miRNA RT Primer 引物为5'-CAGGTCCAGTTTTTTTTTTTTTTTVN-3',定量扩增用特异性上下游引物进行扩增,下图2是以 hsa-miR-21 为实例说明特异性上下游引物的设计方法(Biorab的microRNA 荧光定量 PCR 试剂盒提供所有 miRNA 检测,货号:MTAXXXXX,所有引物均经过设计优化,详细请于引物列表中查询。如果您研究的miRNA分子不在列表中,请来信咨询,我们将及时给您优化设计)。
图1:技术原理图:
图2:hsa-miR-21实例设计原理:
操作方法:
1.按以下组分配制反转录反应液:
4×One step miRNA RT Solution
5μl
Rnase-Free H2O
Up to 20μl
2. 在PCR 仪上按以下条件进行反应:
37℃——————60min
95℃——————5分钟
3.获得 cDNA 产物后使用microRNA 荧光定量 PCR 试剂盒进行 miRNA 定量检测。使用该试剂盒反转录所得 cDNA 产物包含了样品中所有miRNA 反转录产物,可用于多个基因的检测分析,可使用内参基因进行定量矫正。内参基因可选择使用RNU6B miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01501),适用于来源于人和鼠等哺乳动物的样品;RNU44 miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01502)、 RNU48 miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01503),适用于来源于人的样品;SnoRNA135 miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01504) 、SnoRNA202 miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01505)适用于来源于鼠的样品。Biorab 提供的内参扩增引物浓度均为 10μM,每 20μl 反应体系中加入0.4-0.8μl。
根据机型选择步骤A或B,配制反应体系:
步骤A: 需要添加 ROX 染料进行反应孔间信号矫正的Real-Time PCR 仪,包括:ABI PRISM7000/7700/7900HT,7300/7500/7500 Fast Real-Time PCR(Applied Biosystems);Mx3000P(Stratagene)等。按照如下组分配制 20μl PCR 反应体系:
5×Top HS SYBR Green qPCR Mix
4μl
1×
50×ROX Reference Dye
0.4μl
1×
PCR Forward Primer(10μM)
0.4-0.8μl
PCR Reverse Primer(10μM)
0.4-0.8μl
注:引物初次使用请用0.4μl,视实验结果进行调整。
步骤B:无需添加 ROX 染料进行反应孔间信号矫正的Real-Time PCR 仪,包括:LightCycler(Roche Diagnostics);MiniOpticon、Opticon2、MyiQ 2、CFX96 Real-Time PCR(Bio-Rad & MJ);Line-Gene(Bioer,杭州博日)等。按照如下组分配制 20μl PCR 反应体系:
5×Top HS SYBR Green qPCR Mix
4μl
1×
PCR Forward Primer(10μM)
0.4-0.8μl
PCR Reverse Primer(10μM)
0.4-0.8μl
4.进行 Real-Time PCR 反应,通常采用两步法,程序如下:
注意:使用该方法通常可以准确检测到>0.01fM的microRNA 分子,过多的循环数会造成精确性降低。推荐的循环数为 30 个,在检测极低样品浓度时可将循环数调整到35 个。
5.扩增结果分析和数据处理:
反应结束后确认 Real-Time PCR的cDNA 样品和 NTC 阴性对照的扩增曲线和融解曲线。