meDIP-Kit

技术原理

<b>meDIP（Methylated DNA Immunoprecipitation，甲基化DNA免疫共沉淀）</b>是一种基于免疫沉淀原理的DNA甲基化检测技术，用于在全基因组水平富集和分析甲基化修饰区域。DNA甲基化是由DNA甲基转移酶催化形成的表观遗传修饰，主要发生在胞嘧啶碱基上。meDIP实验中，先通过超声破碎将基因组DNA片段化，随后利用DNA甲基化抗体特异性识别并富集甲基化DNA片段。产物可进行qPCR验证，或经文库构建后进行高通量测序，实现对全基因组甲基化区域的系统性分析。

技术应用

（1）结合NGS建库与测序，meDIP可在基因组水平鉴定高甲基化区域（m5C、5hmC等）；<br>

（2）结合qPCR，meDIP可用于比较不同样本之间的基因甲基化差异；<br>

（3）用于肿瘤表观遗传学、发育生物学等科研实验中。

技术特点

（1）与WGBS相比，meDIP不具备单碱基分辨率，分辨率约200-500bp，适合全基因组甲基化区域的初步筛查；以及meDIP实验流程中无需开展亚硫酸氢盐修饰即可量化甲基化程度，测序深度要求也较WGBS低；同时meDIP实验搭配不同甲基化抗体可以筛选不同甲基化修饰类型。<br>

（2）与BSP相比，meDIP可检测的甲基化覆盖范围广，但无法提供单碱基精度，meDIP-seq常用于前期发现甲基化基因，而BSP用于甲基化基因的精确验证。<br>

（3）与MSP相比，meDIP-qPCR无需针对甲基化与非甲基化位点设计引物，实验获取到的序列即为甲基化序列，常通过抗体富集效率比较不同条件样本的甲基化差异；而MSP利用甲基化引物与非甲基化引物进行qPCR，对目标序列进行半定量分析。<br>

（4）与meDIP-seq与meDIP-qPCR联用：先通过meDIP-seq进行全基因组筛查，发现差异甲基化基因，再用meDIP-qPCR对关键候选基因进行快速、低成本的验证，形成完整的发现-验证流程。

产品优势

（1）适配多种甲基化抗体，可用于研究不同类型的DNA甲基化。<br>

（2）含DNA提取模块：甲基化抗体捕获的DNA为100-300bp的小片段DNA，回收难度大，本产品含有成熟简单的小片段DNA提取材料及试剂，显著提升回收效率。<br>

（3）实验起始样本为DNA，实验无物种类型限制。<br>

（4）检测周期短：全实验周期低于3h。