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发布人：武汉艾美捷科技有限公司
发布日期:2024/12/17 16:39:41
EpiNext CUT&LUNCH检测试剂盒是一套完整的优化试剂，专为以下目的而设计：
1、快速富集蛋白质（组蛋白或强结合转录因子）特异性DNA复合物
2、通过qPCR或下一代直接从细胞中提取蛋白质和DNA之间的相互作用
3、使用Illumina平台进行测序。
艾美捷EpiNext CUT&LUNCH检测试剂盒（P-2035-24）使用前需知事项：
起始材料：起始材料可以包括各种哺乳动物细胞样本，如培养瓶或培养板中的培养细胞、原代细胞、从血液、体液中分离出的稀有细胞群体、新鲜/冷冻组织以及从整个细胞群体和胚胎细胞中分选出来的特定细胞等。
细胞输入量：每个反应的细胞量可以是2 x 10^3到5 x 10^5个细胞。为了最佳制备，细胞输入量应该是2 x 10^5，尽管对于修饰组蛋白，即使只有500个细胞也可获得结果。
抗体：抗体应为ChIP级别，以便识别与DNA或其他蛋白结合的蛋白。如果您使用的抗体尚未针对ChIP进行验证，则应使用适当的对照抗体，如抗RNA聚合酶II、抗H3K4me3或抗H3K9me3，以证明这些抗体适用于ChIP。
内部对照：此试剂盒提供了CUT&LUNCH使用的阴性和阳性对照。
注意事项：为避免交叉污染，仔细地将样品或溶液滴入管中或瓶中。使用防气溶胶的移液管头，并在液体转移之间始终更换移液管头。在整个操作过程中佩戴手套。如果手套与样品接触，立即更换手套。
运输与储存：
该试剂盒分两部分运输：第一部分在常温下运输，第二部分在4°C的冷冻冰袋中运输。
收到后，请根据上表的温度要求，在避光条件下储存各组分。
注意：使用前请检查洗涤缓冲液（WB）和渗透缓冲液（PB）是否含有盐分沉淀。如果有，请在室温或37°C下短暂加热并摇动，直到盐分重新溶解。
如果储存得当，试剂盒的所有组分自发货日期起稳定6个月。
CUT&LUNCH检测具有以下优点和特点：
• 极快的3步协议：从完整的细胞开始，无需ConA固定。整个过程可以在1小时50分钟内完成，最小化核损伤和染色质损失，同时保持天然染色质结构。
• 提高特异性和最小化背景：独特的核酸切割酶通过选择性地在目标蛋白/DNA复合物的两端切割DNA，确保低序列偏差，不影响与蛋白结合的DNA。非特异性蛋白-DNA复合物被选择性地消除，实现目标蛋白富集区域的高分辨率映射。
• 低输入材料：在最短时间内完成强大的未结合DNA切割和免疫捕获。这种方法使用细胞和组织，同时提供目标蛋白的最大降解保护和最小样本损失。因此，输入的细胞量可以少至500个细胞。
• 广泛适用性：适用于各种物种的培养细胞以及新鲜或冷冻组织，与组蛋白和转录因子兼容，同时保持检测的特异性和灵敏度。
• 高度便捷：试剂盒包括所有必要的组分，使EpiNext™ CUT&LUNCH试剂盒既方便又经济。
• 与现有流程无缝集成：富集的DNA用于NGS，可以使用现有的、经过时间考验的ChIP-seq生物信息学软件和工具进行分析。
图：使用EpiNext 富集靶蛋白/DNACUT&LUNCH检测试剂盒：捕获组蛋白/DNA复合物通过阳性对照抗体（H3K4me3）从200000
MCF-7细胞。非免疫性IgG用作阴性控制。富集的DNA被纯化并发出荧光通过Qubit定量或通过qPCR分析，靶向GAPDH启动子用于富集倍数比较。
EpiNext CUT&LUNCH 检测试剂盒pk传统 CUT&RUN/芯片
CUT&LUNCH
工作流程方便程度：方便；总共只需 19 个步骤
所需细胞数量：2,000 - 500,000
分析目标范围：适用于组蛋白、适用于TF蛋白
裂解和收集的 DNA 的特异性：稳定;不依赖于样品中所含目标分子的数量；不受目标类型和数量的影响
序列分辨率：高
负/阳性对照率 （%）：5%
检测时间长度：1 小时 50 分钟
每次检测反应的价格：低
传统 CUT&RUN
方便：不太方便>总共 50 步
所需细胞数量：5,000 - 500,000
分析目标范围：适用于组蛋白、不适用于TF蛋白
裂解和收集的 DNA 的特异性：稳定;根据样品中所含目标分子的数量而变化、受目标类型和数量影响
序列分辨率：高
负/阳性对照率 （%）：30%
检测时间长度：6 小时 - 2 天
每次检测反应的价格：高
芯片
方便：因不同的 ChIP 检测而异
所需细胞数量：100 - 10,000,000
分析目标范围：适用于组蛋白、适用于TF蛋白
裂解和收集的 DNA 的特异性：不适用
序列分辨率：中等
负/阳性对照率 （%）：20%
检测时间长度：对于不同的 ChIP 检测，从 4 小时 - 2 天不等
每次检测反应的价格：不同
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