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发布人:武汉艾美捷科技有限公司
发布日期:2024/12/17 16:39:14
在体内富集组蛋白或转录因子(TF)结合的DNA,随后进行qPCR和/或下一代测序,为研究全基因组蛋白质-DNA相互作用提供了一个有利的工具。通常用于实现这一目标的主要方法是免疫沉淀后测序(ChIP-seq)。这种方法包括高度特异的ChIP-exo和ChIP-nexus。这两种实验提供高分辨率的映射。然而,这些实验的主要局限性在于它们需要大量的输入材料、细胞或组织,以产生足够强的信号,超过背景噪音。CUT&RUN(靶向裂解和核酸酶释放)是为了使用有限的生物材料对蛋白质-DNA相互作用进行映射而开发的,它需要更少的样品量,同时显著提高了映射分辨率。然而,这种实验的一个相当大的缺点是抗体未耦合pAG-MNase的非特异性裂解,显著限制了CUT&RUN在不同物种和细胞/组织类型中大多数转录因子的特异性使用。此外,原始CUT&RUN步骤繁琐,需要优化实验条件,仍然耗时。
艾美捷EpiNext CUT&LUNCH检测试剂盒(P-2035-24)整合ChIP和CUT&RUN的所有优势,克服其缺点,EpiNext CUT&LUNCH(靶向裂解并均匀解放独特核酸复合物)检测试剂盒可以在创纪录的时间内实现对目标蛋白质/DNA复合物的高度特异富集。
EpiNext CUT&LUNCH检测试剂盒极速 3 步方案:
为什么要花费数天时间进行传统的CUT&RUN或ChIP实验,当你可以在不牺牲性能的情况下更快地实现蛋白质/DNA富集呢?使用EpigenTek的新CUT&LUNCH套件,你可以在仅一个早晨的实验中迅速富集目标蛋白质/DNA复合物。
EpiNext CUT&LUNCH 检测试剂盒特色:
快速方案:在不到2小时内完成实验。
低非特异性背景:仅有3-5%的非特异性DNA结合。
高特异性和分辨率:DNA在富集目标蛋白质区域的两端被选择性地切割。
具有成本效益:与传统的CUT&RUN实验相比,每次反应的价格几乎是一半。
无需特殊软件:使用现有经过时间考验的ChIP-seq生物信息学流程来进行NGS数据分析。
保存建议:
该试剂盒分两部分运输:第一部分在室温下,第二部分在4°C的冷冻冰袋上。
收到后,根据上表中的温度避光储存组件。
注:使用前检查WB(清洗缓冲液)和PB(透化缓冲液)是否含有盐沉淀。 如果是这样,请在室温或37°C下短暂加热并摇晃,直至盐重新溶解。
试剂盒的所有组分在适当储存的情况下,自装运之日起可稳定储存6个月
EpiNext CUT&LUNCH 检测试剂盒pk传统 CUT&RUN/芯片
CUT&LUNCH
工作流程方便程度:方便;总共只需 19 个步骤
所需细胞数量:2,000 - 500,000
分析目标范围:适用于组蛋白、适用于TF蛋白
裂解和收集的 DNA 的特异性:稳定;不依赖于样品中所含目标分子的数量;不受目标类型和数量的影响
序列分辨率:高
负/阳性对照率 (%):5%
检测时间长度:1 小时 50 分钟
每次检测反应的价格:低
传统 CUT&RUN
方便:不太方便>总共 50 步
所需细胞数量:5,000 - 500,000
分析目标范围:适用于组蛋白、不适用于TF蛋白
裂解和收集的 DNA 的特异性:稳定;根据样品中所含目标分子的数量而变化、受目标类型和数量影响
序列分辨率:高
负/阳性对照率 (%):30%
检测时间长度:6 小时 - 2 天
每次检测反应的价格:高
芯片
方便:因不同的 ChIP 检测而异
所需细胞数量:100 - 10,000,000
分析目标范围:适用于组蛋白、适用于TF蛋白
裂解和收集的 DNA 的特异性:不适用
序列分辨率:中等
负/阳性对照率 (%):20%
检测时间长度:对于不同的 ChIP 检测,从 4 小时 - 2 天不等
每次检测反应的价格:不同
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