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现货 | 从“总RNA”到“新生RNA”:5-Ethynyl-UTP标记技术解析

发布人:深圳市金赛途生物科技有限公司

发布日期:2026/8/18 15:20:03

核苷类原料

5-Ethynyl-UTP


在RNA研究领域,常常面临这样的疑问:细胞中到底在发生什么?虽然当前的测序技术已经能够精准测定细胞中“有哪些”RNA,但研究人员越来越发现:仅仅检测“总RNA”远远不够。

因为,总RNA本质上是一个复杂的“混合体”,它同时包含了:

● 已存在且稳定的RNA
● 正在降解的RNA
● 刚刚转录出来的新生RNA

这三者混合在一起,使得一些关键的科研问题变得模糊不清:

● 药物刺激后,特定的靶基因是真的被激活转录了,还是仅仅降解变慢了?
● 某个发育关键基因,究竟是在什么精确时间点开始表达的?
● 病毒入侵细胞后,哪些病毒RNA最先被复制出来?

仅依靠传统的总RNA检测,很难给出精准、动态的时间轴答案。

一、从“总RNA”到“新生RNA”

如果能够在RNA合成过程中,对刚刚产生的新生RNA进行特异性标记,就可以将“正在发生的转录活动”与细胞中已经存在的RNA区分开来。

这正是新生RNA代谢标记技术(Nascent RNA Labeling)的核心思路。

通过向细胞提供经过化学修饰的核苷三磷酸,使其在RNA转录过程中被掺入新合成的RNA链,再利用特异性的化学反应进行检测或富集,研究人员便能够进一步追踪RNA的产生、变化及动态过程。

其中,5-Ethynyl-UTP(5-乙炔基尿苷5ʹ-(四氢三磷酸))是一种重要的化学修饰核苷三磷酸,可用于新生RNA的标记,并为后续检测、富集及测序分析提供化学基础。


二、产品概览

1004955-96-7.png

中文名:5-乙炔基尿苷 5ʹ-(四氢三磷酸)

英文名:5-Ethynyluridine 5ʹ-(tetrahydrogen triphosphate)

简  称:5-Ethynyl-UTP

CAS号:1004955-96-7

分子式:C11H15N2O15P3

分子量:508.16

规  格:25 ul / 100 ul / 1 ml(支持定制包装)

形  态:水溶液

货  号:G09010023

库  存:现货

浓  度:~100 mM in water

5-Ethynyl-UTP是一种可直接掺入RNA分子的化学修饰核苷三磷酸,是实现新生RNA标记、检测与富集的核心原料。


三、工作原理

为了突破这一瓶颈,新生RNA代谢标记技术应运而生。而实现这一技术的关键,正是一款高效的化学修饰核苷酸——5-Ethynyl-UTP。

它的工作原理非常精妙且高效:

1. 精准掺入:在体外转录体系或通透性细胞系统中,RNA聚合酶将5-Ethynyl-UTP识别为普通的 UTP,并直接掺入到新合成的RNA链中。因此,在标记窗口内合成并掺入该核苷类似物的RNA可获得相应的化学标记。
2. 点击化学反应:利用5-Ethynyl-UTP末端的炔基(-C≡CH)这一微小的“把手”,通过点击化学反应,可利用炔基与叠氮基之间的生物正交反应进行后续标记。
3. 定向追踪:通过这种稳定的共价连接,通过共价连接将相应报告基团引入已标记的新生RNA,从而实现后续检测或富集。

四、应用场景

标记后,我们能做什么?5-Ethynyl-UTP不仅仅是一个化学标记,更是打开RNA生命动态窗口的钥匙。在实际科研中,它能帮您完成以下核心工作:

1. 检测RNA合成速率与转录动力学

动态监测细胞在特定生理、病理或微环境刺激(如小分子干预、环境应激、细胞分化等)下,转录水平的瞬时波动。

2. 解析转录调控机制与小分子抑制剂效应

在转录调控及药物筛选研究中,5-Ethynyl-UTP 是定量评估候选化合物对转录系统干预效应的灵敏指标。

3. 新生RNA的特异性富集与高通量测序(EU-seq)

利用点击化学将生物素-叠氮偶联至新生RNA,再经链霉亲和素磁珠亲和纯化,可实现新生RNA的特异性富集与高通量测序分析,用于非编码RNA和前体mRNA加工与降解动力学研究。


五、核心优势

与传统的放射性同位素标记(如³²P-UTP)或较旧的抗体检测法(如Br-UTP)相比,5-Ethynyl-UTP展现出明显的技术优势:

● 灵敏与低噪:点击化学反应效率高,信号清晰,背景低,可用于低丰度新生RNA的标记及后续检测。
● 生物正交特异性:炔基与叠氮基具有良好的生物正交性,有利于降低非特异性反应对标记结果的影响。
● RNA完整性保护:反应条件温和,对RNA结构损伤小,可与后续测序、qRT-PCR等分析流程衔接,为新生RNA研究提供标记基础。
● 无需放射性标记:无需使用³²P等放射性核素,可减少放射性实验相关的操作与管理要求。


扩展服务

以化学标记,捕捉RNA合成变化。

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