microRNA命名的变迁记

今天我们来深入探讨一下microRNA命名背后的故事。

当一些研究者从项目团队接手或从GEO等公共数据库中获取microRNA数据时，他们可能会惊讶地发现，许多microRNA的名称在最新的miRBase数据库中已经发生了变化。

这种变化给我们使用数据库进行如靶基因预测等分析带来了挑战：我们不确定应该使用哪些名称才能确保被系统正确识别，也不清楚这些名称背后的具体含义。

以hsa-miR-199a*为例，它现在被称为hsa-miR-199a-3p。这一转变背后隐藏着怎样的故事呢？

让我们从microRNA的生成机制说起。请看下图：

在microRNA的形成过程中，“茎-环”前体经过加工，切除了“环”结构，留下了一个双链的“茎”。这个双链“茎”的每一侧都会形成一个成熟的microRNA，因此一个前体最多可以产生两个成熟的microRNA。

过去，研究者们根据这两条microRNA的表达量高低来命名它们，高表达量的直接称为miR-xxx，而低表达量的则在其后加上星号（），如miR-xxx。此外，还有使用“-s”和“-as”后缀进行区分的做法。

然而，表达量的高低并非绝对，且易受实验误差影响，因此这种命名方式并不科学。为了解决这个问题，从miRBase 17.0版本开始，对成熟体microRNA的命名规则进行了调整：根据它们源自“茎-环”结构的哪一端，分别在后缀上添加“-5p”或“-3p”。

现在，我们明白了为什么hsa-miR-199a*现在被称为hsa-miR-199a-3p。

值得注意的是，并非所有“茎-环”结构的microRNA前体都会产生两个成熟体。如果只有一个产物，其名称后则不会添加任何后缀。

上海优宁维生物科技股份有限公司

试剂 | 耗材 | 仪器 | 软件 | 定制 | 实验服务 | 供应链

免费热线：4008-168-068

咨询邮箱：info@univ-bio.com

订购商城：www.univ-bio.com

微信公众平台：优宁维抗体专家，欢迎关注！

小优博士（小程序）：5大课堂, 让你的科研不再难！