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牙龈卟啉单胞菌探针法荧光定量PCR试剂盒使用手册

发布人:上海晶风生物科技有限公司

发布日期:2024/11/7 9:14:53

 

CAT#:15-42900

低温运输-20℃保存

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

牙龈卟啉单胞菌探针法荧光定量PCR试剂盒

Porphyromonas gingivalis Probe qPCR Kit

使用手册V1.0

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

产品及特点

牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)是一种非酵解糖的革兰氏

阴性厌氧球杆菌,是研究广泛且证据充足的重要牙周炎致病菌之一。它不仅可以

引发牙周炎,还能导致现在常见的抗生素抗性。它会把对牙齿有益的细菌挤走,

并取代它们的位置。牙龈卟啉单胞菌一旦失控,它最终会导致牙齿从牙龈上脱落

下来。国外有学者研究发现 37%的 0-18 岁个体中均可检测到牙龈卟啉单胞菌,

是人类健康的重大威胁。因此对牙龈卟啉单胞菌进行快速灵敏的诊断具有重要的

意义。本产品就是以探针法荧光定量 PCR 技术为基础开发的专门检测牙龈卟啉

单胞菌的试剂盒,它具有下列特点:

  1. 即开即用,用户只需要提供样品DNA模板。
  2. 引物和探针经过优化,灵敏性高
  3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
  4. 特异性高,引物是根据牙龈卟啉单胞菌高度保守区设计,不会跟其他微生物的DNA发生交叉反应。
  5. 既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量级。
  6. 本产品足够50次20μL体系的探针法荧光定量PCR反应。
  7. 本产品只能用于科研

 

格及成分

编号

五孔包装

2×Probe qPCR MagicMix

190303

500μL

荧光 PCR 专用模板稀释液

180701

1ml

纯净水

100935

1ml

牙龈卟啉单胞菌探针法qPCR

引物-探针混合液

15-42900yp

150μL

牙龈卟啉单胞菌探针法qPCR

 阳性对照(1×10E7 拷贝/μL)

42900pc

50μL

使用手册

15-42900sc

1份

 

 

运输及保存

低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。

 

自备试剂

样品DNA

 

使用方法

一、稀释标准曲线样品(以10E1-10E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性DNA片段作为阳性对照。

  1. 标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。
  2. 用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同
  3. 6号管中加入5 μL 10E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得10E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
  4. 换枪头,在5号管中加入5 μL 10E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得10E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
  5. 换枪头,在4号管中加入5 μL 10E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得10E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
  6. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。

二、样品DNA的制备

  1. 如果N个样品待提取最好设置N+2个提取,多出的是PC(样品制备阳性对照)NC样品制备阴性对照)。可以取阳性对照的1000倍稀释液10μL再加上一定量的水,使总体积与待提取样品的规定体积一致,以此作为PC另外用水作为NC。
  2. 用自选方法纯化样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容。

三、Probe qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行

  1. 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个于上步得到N+2个样品1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个于上步得到N+2个样品1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR性对照(用第4号管的阳性对照稀释液做模板)下面只以定量分析为例描述操作步骤
  2. 标记管中下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖子储存后最后加):

成分/每管

样品管

N+2

PCR阴性对照管

标准曲线

样品管(1-6管)

2×Probe qPCR MagicMix

10 μL

10 μL

10 μL

牙龈卟啉单胞菌探针法qPCR引物-探针混合液

3 μL

3 μL

3 μL

 N+2个待测DNA模板

7 μL

-

-

纯净水

-

7 μL

-

6所得标准曲线样品稀释液1-6

-

-

7 μL(1号样1号管2号样2号管

  1. 盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:

过程

温度

时间

预变性

95

10 min

PCR反应

45个循环)

95

15 sec

60

60 sec(采集FAM通道的荧光信号

数据处理

  1. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品核酸浓度的log值,推算出其浓度
  2. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于38。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于386则为阳性。如果在38-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。

 

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