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一文全面解析新冠病毒JN.1变异株

发布人:武汉佰乐博生物技术有限公司

发布日期:2024/9/11 13:51:07

近日,继世界卫生组织(WHO)将新冠变异株JN.1单独列为“需要留意的变异株”(Variant of Interest,VOI)后,国家卫生健康委在介绍冬季呼吸道疾病防治和元旦期间健康提示有关情况的新闻发布会中介绍,JN.1变异株在全球范围内快速上升,已经成为主要流行株;当前我国新冠的形势处于低水平流行,JN.1变异株占比也比较低,但也呈上升趋势,有可能逐步发展成为国内流行株。

 

JN.1变异株

JN.1(BA.2.86.1.1)是最近出现的SARS-CoV-2变体,是BA.2.86谱系的后裔。JN.1于2023年8月首次被发现,后广泛传播于美国、英国、法国等多个国家和地区。JN.1在系统发育上与目前流行的Omicron XBB谱系差距较大,JN.1在刺突蛋白中包含一个标志性突变L455S,在非刺突蛋白中包含其他三个突变。

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SARS-CoV-2主要谱系的流行情况出现和的模式

 

JN.1由BA.2.86的快速演变

JN.1是新冠病毒的变异株BA.2.86的亚谱系。BA.2.86变异株S蛋白有30多个不同的氨基酸突变位点(红色标示),主要位于S蛋白S1亚基的NTD和RBD区。

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BA.2.86与其他谱系相比显示出许多新的突变

 

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BA.2 S蛋白的晶体结构,其中青色为NTD区,绿色为RBD区,蓝色为RBM区,红色标示在BA.2.86 S蛋白中与BA.2 S蛋白中不同的突变位点

 

与BA.2.86相比,具有额外尖峰突变L455S的JN.1显著增强了免疫逃避能力,而牺牲了ACE2结合亲和力的降低。这种突变可能会增加JN.1病毒的传染性,并且使JN.1能够有效地逃避中和抗体,抵消BA.2.86的易感性,从而使其在体液免疫回避方面超过其前体BA.2.86和主流变体HV.1(XBB.1.5+L452R+F456L)和JD.1.1(XBB.1.5+L455F+F456L+A475V)。

 

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BA.2.86.1和JN.1变异的比较分析

 

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JN.1表现出严重的免疫逃逸和ACE2结合亲和力下降

 

从BA.2.86到JN.1的快速演变,类似于早期从BA.2.75到CH.1.1的过渡,这些毒株可以在低水平上生存和传播,因为它们与显性毒株的抗原距离很大,允许它们以不同的人群为目标,并迅速积累免疫规避突变,通常以牺牲受体结合亲和力为代价。

 

JN.1的病毒学特性

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发表于BioRxiv上题为“Virological characteristics of the SARS-CoV-2 JN.1 variant”的文章对JN.1的病毒学特性进行了研究。用感染BA.2.86或用BA.2.86 S蛋白免疫的鼠血清进行了中和试验。在这两种情况下,针对JN.1的50%中和效价(NT50)与针对BA.2.86的50%中和效价相当,表明S:L455S不影响BA.2.86的抗原性。另一方面,XBB.1.5和EG.5.1对JN.1的突破感染(BTI)血清的NT50明显低于HK.3(2.6- 3.1倍)和BA.2.86(3.8倍)。与BA.2.86相比,JN.1对单价XBB.1.5疫苗血清表现出强大的抗性。

 

这些结果表明,JN.1是迄今为止最容易逃避免疫的变异之一。但是还没有足够的证据表明JN.1变异株会导致更严重的病情或更高的死亡率,也没有证据表明JN.1变异株会降低现有疫苗和治疗药物的有效性。

 

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Antibodies

Product name
Catalog
Research Grade Amubarvimab
DVV00311
Anti-SARS2 RBD Antibody(S2H97)
DVV00317
Anti-SARS2 RBD Antibody(S2E12)
DVV00318
Research Grade Sotrovimab
DVV00307
Research Grade Cilgavimab
DVV00302
Research Grade DXP-604
DVV00320
Research Grade Romlusevimab
DVV00312
Research Grade Bebtelovimab
DVV00319
Research Grade Adintrevimab
DVV00315
Research Grade Anti-SARS-CoV-2 RBD (6M6)
DVV00334
Research Grade Anti-SARS-CoV-2 RBD (COV44-62)
DVV00335
Research Grade Anti-SARS-CoV-2 RBD (COV44-79)
DVV00336
Research Grade Anti-SARS-CoV-2 RBD (ADI-62113)
DVV00337
Research Grade Anti-SARS-CoV-2 RBD (Beta-27 Fab)
DVV00338
Research Grade Anti-SARS-CoV-2 RBD (C1)
DVV00339

Recombinant antigens

Product name
Catalog
Recombinant SARS-CoV-2 RBD(JN.1) Protein, C-His
EVV00342
Recombinant SARS-CoV-2 RBD(Omicron/BA.2) Protein, C-His
EVV00324
Recombinant SARS-CoV-2 RBD(Omicron_BA.3) Protein, C-His
EVV00327
Recombinant SARS-CoV-2 RBD(Omicron/BA.4) Protein, C-His
EVV00328
Recombinant SARS-CoV-2 RBD(Omicron/BA.5) Protein, C-His
EVV00329
Recombinant SARS-CoV-2 RBD(Omicron/B.1.1.529) Protein, C-His
EVV00325

 

温馨提醒:节假日在即,人员流动和聚集性活动增多,可能增加传染病疫情传播风险。与预防其他奥密克戎变异株感染一样,坚持保持良好个人卫生习惯,科学佩戴口罩,及时接种疫苗,坚持规律作息,保证健康饮食,提高机体免疫力。

 

参考文献

[1] Sijie Yang, Yuanling Yu, Yanli Xu, et al.Fast evolution of SARS-CoV-2 BA.2·86 to JN.1 under heavy immune pressure.Lancet Infect Dis.2023 Dec 15:S1473-3099(23)00744-2.doi: 10.1016/S1473-3099(23)00744-2. Online ahead of print.

[2] Delphine Planas , Isabelle Staropoli , Vincent Michel, et al.Distinct evolution of SARS-CoV-2 Omicron XBB and BA.2.86 lineages combining increased fitness and antibody evasion.bioRxiv.2023 Dec 6:2023.11.20.567873. doi: 10.1101/2023.11.20.567873. Preprint

[3] Xinling Wang, Lu Lu , Shibo Jiang.SARS-CoV-2 Omicron subvariant BA.2.86: limited potential for global spread.Signal Transduct Target Ther.2023 Nov 30;8(1):439. doi: 10.1038/s41392-023-01712-0.

[4]  Yu Kaku , Kaho Okumura , Miguel Padilla-Blanco,et al.Virological characteristics of the SARS-CoV-2 JN.1 variant.bioRxiv.2023 Dec 9:2023.12.08.570782. doi: 10.1101/2023.12.08.570782

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