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稳定同位素标记核酸

发布人:安徽旺山旺水特种气体有限公司

发布日期:2024/4/19 10:36:16

稳定同位素标记核酸

 

了解构成生命基础的分子的复杂性需要专门的工具,其中一种工具是稳定同位素标记的核酸:用同位素标记的 DNA 或 RNA 链不会随着时间的推移而衰变,从而为分子生物学和生物化学提供重要的研究帮助。

 

稳定同位素标记与各种光谱方法相结合,揭示了各种生物分子之间发生的相互作用,以研究疾病根源等科学问题。

 

在这里,我们来看看稳定同位素标记的核酸,解释它们的生产、用途以及对科学理解的影响。

01

引入同位素标记核酸

 

稳定同位素是天然存在的化学元素变体,其原子核内的中子数量不同,从而产生不同的原子质量。与随时间推移自发衰变并发射辐射的放射性同位素不同,稳定同位素是非放射性的,不会随时间变化或衰变。这种稳定性使它们可以安全地用于生物研究和医学应用。

 

分子生物学中一些常用的稳定同位素通常包括2 H、13 C、15 N 和18 O。这些同位素与其更丰富的同位素具有相同的化学性质,但可以使用 NMR 等技术根据其原子质量轻松区分和质谱分析。

 

稳定同位素标记涉及将稳定同位素有意掺入生物分子(包括 DNA 和 RNA 等核酸)内的特定原子或位置。标记的分子保留了其天然的生物学特性,但具有独特的同位素特征,使它们能够与未标记的分子区分开来。

02

不同类型的同位素标记

 

有多种类型的稳定同位素标记的 RNA 和 DNA 构建模块可供选择,每种类型在分子生物学研究中都有不同的应用。这些包括:

 

rNTP(三磷酸核糖核苷)

 

稳定同位素标记的 rNTP是用于合成 RNA 分子的构建模块。通过将13 C 和15 N等稳定同位素纳入 rNTP,研究人员可以生成标记的 RNA 分子,用于多种研究,包括转录调控、RNA 折叠和 RNA-蛋白质相互作用。

 

dNTP(脱氧核糖核苷三磷酸)

 

与 rNTP 类似,dNTP充当 DNA 合成的构建模块。标记的 dNTP 用于合成同位素标记的 DNA,用于 DNA 复制、修复和动力学研究。

 

氟rNTP

 

氟-rNTP是含有氟原子的修饰 rNTP。氟标记允许使用 19F NMR 光谱研究 RNA 结构和相互作用,从而提高灵敏度和特异性。

 

修饰核苷酸

 

稳定同位素标记可应用于修饰的核苷酸,例如甲基化或乙酰化的核苷酸,使研究人员能够研究核苷酸修饰对核酸结构和功能的影响。

 

亚磷酰胺

 

亚磷酰胺是稳定同位素标记的前体,用于寡核苷酸的化学合成。这些构建模块允许定制合成具有特定序列和修饰的标记 DNA 或 RNA 寡核苷酸。

 

稳定同位素标记核酸在研究中的用途

 

稳定同位素标记的核酸已成为分子生物学和生物化学研究中的强大工具,并用于许多应用。通过用稳定同位素标记 DNA 或 RNA 链,科学家可以仔细追踪它们在细胞内的路径和相互作用,从而揭示生命基本过程的新见解。

 

稳定同位素标记核酸的使用延伸到 RNA 动力学的研究,特别是 RNA 合成和降解。通过将标记的核糖核苷三磷酸整合到新的 RNA 分子中,可以追踪特定 RNA 物种的生命周期,阐明 RNA 降解和周转的机制。

 

此外,这些标记的核酸有助于研究蛋白质和核酸之间的相互作用。表面等离子体共振和核磁共振等技术与标记核酸相结合,使研究人员能够绘制蛋白质-核酸相互作用的位点和强度图,加深我们对 DNA 复制、RNA 加工和基因调控的理解。

03

Q&A

什么是稳定同位素标记?

 

稳定同位素标记是分子生物学和生物化学中使用的一种技术,其中稳定(非放射性)同位素被整合到分子中。通过用相对同位素替换分子中的某些原子,科学家可以追踪分子在生物系统内的路径和相互作用。它充当一种分子“标签”,为代谢、DNA 复制、RNA 转录和蛋白质-核酸相互作用等生化过程提供有价值的见解。

 

什么是常见的稳定同位素?

 

生物研究中常用的稳定同位素包括碳 13 ( 13 C)、氮 15 ( 15 N) 和氘 ( 2 H 或 D)。这些同位素是非放射性的,因此“稳定”,并且它们独特的性质可以使用质谱或核磁共振等技术进行检测,这使得它们成为跟踪生物系统内分子的理想选择。

 

为什么同位素标记很重要?

 

同位素标记对于追踪生物系统内分子的途径和相互作用至关重要。它提供了有关分子在从新陈代谢到基因表达等各种过程中的作用的有价值的信息。此外,由于这些同位素是非放射性的,它们可以安全地用于生物体,从而可以在自然环境中实时研究生物过程,从而增进我们对分子水平上生命的理解。

 

同位素如何用于生物标记?

 

同位素通过将其合并到生物分子的构建块中来用于生物标记。例如,在核酸标记中,同位素标记的脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸分别用于DNA或RNA合成。然后可以使用特定的检测技术来追踪这些标记的分子。通过观察它们的行为和相互作用,研究人员可以深入了解从 DNA 复制和转录到蛋白质-核酸相互作用的各种生物过程。

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