全基因组关联分析

概述基本原理

全基因组关联分析性质、用途与生产工艺

概述
全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)是研究复杂性状和疾病遗传变异的有效方法,其核心是研究分子变异和目标表型性状之间的关联。尤其是近几年来随着高通量测序和高分辨的代谢检测技术的不断发展,以及多种生物信息学技术和统计学方法发展,这些为复杂性状致因变异的精细定位提供基础。
基本原理
全基因组关联分析（GWAS）依赖于连锁不平衡检测群体的遗传变异与性状之间的关联，然后通过统计基因型和表型的关联性大小筛选出影响显著的遗传变异。因此，全基因组关联分析（GWAS）通过分析遗传变异和表型变异的关联性，定位影响表型性状的重要数量性状位点(QTL)和候选基因，从而确定其遗传机制。全基因组关联分析（GWAS）的一般分析流程为采集样品和表型记录、基因分型、群体分层分析、关联分析、SNP注释和候选基因筛选、连锁不平衡分析和单倍型分析。

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