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磺化Cy7是Cy7(Cyanine 7)的水溶型。它的光谱性质和Cy7类似，属近红外荧光染料。由于它的荧光波长（Em：774nm）恰好处于肌体组织近红外窗口 I 的区域（肌体的血液，体液和组织此区域背景荧光弱，而长波长穿透性强），所以磺化Cy7常常应用于小动物活体体内成像中。磺化Cy7荧光肉眼不可见，显微镜观察时需要近红外滤片，很多荧光显微镜（包括共聚焦显微镜）并不配备，但是流式细胞仪（flow cytometry）常常配备Cy7滤片组。磺化Cy7是常用荧光染料，磺化Cy7可以用来标记核酸，蛋白，抗体，多肽等，它是最常见的小动物显影剂之一。
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy7分子连接到目标分子上。
磺化Cy7-伯胺的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy7水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到蛋白表面后不会引发疏水性蛋白聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy7-伯胺也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行。
Cy7-伯胺标记后的产物Ex/Em是748/774nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 750，DyLight 755等。

• 磺化Cy7水溶性高，极性强，如需脂溶性标记染料，请选择普通Cy7-伯胺。
• 标记时使用不含氨基的缓冲体系，比如磷酸钠缓冲液（PBS），Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等，它们会和磺化Cy7上的伯胺竞争。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
• 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。