非冻型血液DNA保存液
发布日期:2020/3/24 8:40:08
背景[1-6]
非冻型血液DNA保存液在室温条件下长期保存用于DNA提取的血液样品的保存液。它通过裂解细胞并高效抑制DNase的活性而达到长期保证DNA分子的完整性的效果。
操作流程:
1.非冻型血液DNA保存液250mL成分根据要保存的各样本的体积,计算出所需RNAwait用量。RNAwait的用量应当是组织体积的10倍(如100mg组织约用1ml RNAwait);离心收集2×106细胞RNAwait的用量是1ml。
2.将RNAwait按需要量分装入自备保存管中;
3.保存时先将样本浸入RNAwait后置4℃冰箱过夜(4℃过夜是必需的,这样可使RNAwait完全渗入到组织中),然后转移到-20℃冰箱(RNAwait在-20℃时仍为液态,有结晶析出,是正常情况);或者在4℃冰箱过夜后,从RNAwait中取出组织块,转移到-80℃冰箱。在RNAwait中保存的标本,反复冻融至室温20次不影响RNA的质量。
产品特点:
1.非冻型血液DNA保存液250mL成分操作简单,将组织剪薄浸没在RNAWAIT中即可使其RNA不被降解。
2.替代液氮,使样品的保存不需液氮,干冰或-80℃冰箱,尤其适用于临床和野外样品的快速和大规模采集。
完整,因RNAwait能迅速抑制组织中RNA酶的活性,故从中提取的RNA的质量跟液氮保存的样品相比不相上下。
4.方便运输,处理过的样品能在25℃保存一周,使样品邮寄和运输变得容易和便宜,有利学术合作和交流。
5.反复冻融,经RNAwait处理的样品可反复冻融20次,其间可对样品进行各种处理而不影响最终提取的RNA的质量。
6.结果准确,RNAwait进入细胞十分快速,基因表达在发生应急改变前就得以锁定,故RNA分析更能反映取样时的真况。
7.可比性强,RNAwait能减少大规模样品处理中的误差,增加各次实验数据间的可比性,对大规模基因表达谱的分析尤其有用。
8.兼容性广,处理过的样品可以使用TRIzol等试剂提取其RNA,样品还可直接用于组织切片,免疫学和流式细胞分析而不影响RNA的质量。
应用[7][8]
非冻型血液DNA保存液可用于血液循环DNA长期保存:
循环DNA(circulating DNA),又称为游离DNA(cell-free DNA),是存在于血液(血浆或血清)、脑脊液以及滑膜液等体液中的细胞外DNA。随着微量DNA定量检测技术的飞速发展,循环DNA,特别是血液循环DNA,作为一种微创检查中的生物大分子标志物,日益受到人们的关注。人血液循环DNA含量的变化在多种类型疾病的诊断、疗效观察和预后判断中具有重要价值。
然而,由于血液采集、分离、保存方式和样本选择的不同,以及循环DNA提取、纯化和定量方法的差异,各研究结果间缺乏可比性,目前关于健康人血液循环DNA水平和正常参考值范围,尚未见大样本的研究报道。目的建立含有内参照物的血液循环DNA定量检测方法,对健康人血液循环DNA水平进行初步研究,确定其正常参考值范围。方法自行设计并合成人工双链DNA片段,重组到pMD18-T质粒载体中,经基因克隆和多步筛选实验,构建重组质粒,提取质粒DNA,紫外分光光度法对其进行定量,梯度稀释获得标准内参照物。
通过比较四种不同的DNA提取方法对重组质粒DNA的提取效率,选择合适的血液循环DNA提取方法。采用实时荧光定量PCR技术,以三条引物(共用一条下游引物)和两条Taqman荧光探针,同时扩增血浆和血清中的目的基因(人看家基因β-actin)和内参照物(重组质粒DNA),以扩增效率为指标,确定双重实时荧光定量PCR反应中的Mg2+和下游引物的浓度。
由已知的标准内参照物浓度计算得到目的基因的浓度。针对不同的血浆血清用量(200、100、50、10、2和1μl)进行定量检测,确定该方法的敏感性。以紫外分光光度法定量的人基因组DNA投入空白血浆和血清中,以双重实时荧光定量PCR进行定量检测,确定其准确性。针对不同程度稀释的血浆血清DNA样品进行定量检测,确定检测方法的稳定性,并对该检测方法的重复性进行评价。
参考文献
[1]A prospective analysis of cell‐free fetal DNA concentration in maternal plasma as an indicator for adverse pregnancy outcome[J].MargitBauer,GeorgHutterer,MartinaEder,SandraMajer,ErikLeShane,Kirby L.Johnson,IngaPeter,Diana W.Bianchi,BarbaraPertl.Prenat.Diagn..2006(9)
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[3]Análisis de la concentración sérica del ADN tumoral en el cáncer de pulmón no microcítico y avanzado:?esútil como factor pronóstico?[J].Carlos Camps Herrero,Pilar Bayo Zaera,Rafael Sirera Pérez,Eva Sancho Salvador,Ana Blasco Cordellat,María JoséSafont Aguilera.Clinical and Translational Oncology.2005(3)
[4]Human papillomavirus DNA in sera of cervical cancer patients as tumor marker[J].Andreas Widschwendter,Anya Blassnig,Annemarie Wiedemair,Elisabeth Müller-Holzner,Hannes M Müller,Christian Marth.Cancer Letters.2003(2)
[5]O-297 Quantification of free circulating DNA as a diagnostic marker in lung cancer[J].Gabriella Sozzi,Davide Conte,Maria Elena Leon,Rosalia Cirincione,Luca Roz,Elena Roz,Nicola Cirenei,Massimo Bellomi,Giuseppe Pelosi,Ugo Pastorino.Lung Cancer.2003
[6]Maternal serum cell-free fetal DNA levels are increased in cases of trisomy 13 but not trisomy 18[J].Tuangsit Wataganara,Erik S.LeShane,Antonio Farina,Geralyn M.Messerlian,Thomas Lee,Jacob A.Canick,Diana W.Bianchi.Human Genetics.2003(2)
[7]Cell-free DNA:measurement in various carcinomas and establishment of normal reference range[J].Tsu-Lan Wu,Diana Zhang,Ju-Hsin Chia,Kuo-Chien Tsao,Chien-Feng Sun,James T.Wu.Clinica Chimica Acta.2002(1)
[8]陈丹.人血液循环DNA的定量检测研究[D].南京医科大学,2007.
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