RNA长效保存液
发布日期:2020/3/22 17:05:45
背景[1-6]
RNA长效保存液是一种能高效抑制RNase活性的新型小分子混合物,用于防止RNase对RNA的降解作用。组织RNA长效保护液从新鲜组织细胞中提取RNA时,由于各种原因若不能马上处理样品,即使-70℃保存样品中的RNA也不稳定容易降解,而液氮保存既昂贵又不方便。RNA保护液是一种无毒的样品储存液,能迅速渗入新鲜组织细胞的胞浆迅速而强烈灭活生物样品中的RNA酶,抑制RNA降解。
标本在4℃或室温长时间保存,其中的RNA不会降解,免去使用液氮或超低温冰箱的不便,从而有效地解决了样品保存及运输的问题。随后可采用当今世界上各种常见的RNA抽提试剂如RNAtrip、TRIzol或用户自备试剂提取样品RNA。
组织RNA长效保护液使用范围:
1.生物样品已采集完毕,但由不可预测原因不能立即进行RNA提取。
2.异地生物标本保存和运输。如野外采集动植物标本,异地运输或邮寄标本等。
3.没有低温条件或低温设备不可用。如冰箱故障意外停电等。
4.RNase含量特别丰富的组织如胰腺或脾脏,预先用RNA保护液进行预处理,可以获得很好的结果。
5.珍贵样品,取出部分RNA保护液处理过的样品提取RNA,剩余样品可继续冻存于保护液中。可反复冻融并多次取样20次以上。
6.RNA表达分析,不同实验RNA表达的时序变化可立即被RNA保护液固定,减少样品误差。
适用:新鲜生物组织和细胞,如动物组织、植物组织、临床标本、胚胎、真核细胞、血液、细菌、酵母菌,病毒等。但不能用于已经保存冷冻组织和冻融后的组织。
产品特点:
1.高效抑制RNase,保存在RNAsaver中的RNA可以在抵抗100 ng/mL的RNase A的降解作用达36小时,
效果比人胎盘RNase抑制蛋白和RVC更有效。
2.耐高温,100℃保温30分钟后活性不受任何影响。
3.抗氧化,不需要DTT。
4.有效pH范围广。
5.产品为淡红色液体,可以-20℃保存两年。
RNA长效保存液将直接用于溶解RNA沉淀(跟使用RNase-free水一样),然后放置在适当温度下保存(一般在-20℃)。保存在RNApreserve中的RNA可以直接电泳,不影响Northern杂交。但由于RNA保存液会抑制后续酶反应,所以如果RNA要用于RT-PCR等反应,需要预先用LiCl沉淀去除RNA保存液(将1/3倍体积的LiCl加入溶液中,4℃12000~15000g离心20-30分钟,弃上清,用75%乙醇洗一次既得RNA沉淀)。
应用[7][8]
RNA长效保存液可用于RNA及RNA样本的长期保存:
RNA固定剂、固定时间及温度对RNA病毒感染组织总RNA的完整性、得率及病毒RNA扩增的影响。以及固定剂和固定时间对石蜡包埋组织中RNA降解和标本病理形态学的影响。方法:取汉坦病毒76—118株接种乳鼠的感染组织,以沉淀脱水类固定剂100%甲醇、75%乙醇、100%丙酮以及醛类固定剂4%的多聚甲醛磷酸缓冲液(4%PFA)、10%福尔马林共五种固定剂,分别在4℃和室温下固定病毒感染组织6h、12h、24h和48h后,对固定后标本进行如下检测或处理:
1、从固定6h~48h后的标本中直接提取组织总RNA,用琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性;以分光光度计测吸光度计算组织总RNA得率;用巢式RT—PCR扩增病毒RNA序列,电泳检测PCR产物并行灰度扫描。对RNA得率及PCR产物电泳所测灰度值进行统计学分析。2、将固定后的病毒感染组织标本进行石蜡包埋长期保存。对石蜡包埋组织切片后HE染色,镜下观察各种固定剂对组织病理形态学的影响。
从长期保存的各种方式固定后石蜡包埋组织中以RT—PCR扩增出不同片段长度的病毒RNA及β-actin RNA序列,以获得产物长度或对长片段扩增的可重复性及假阴性的多少,来反映各种固定方式对病毒RNA和细胞总RNA降解的影响。结果:
1、病理切片结果显示,经10%福尔马林和4%PFA固定的石蜡切片,组织结构完整清晰。其他三种沉淀脱水类固定剂固定后组织有不同程度收缩,但不影响组织病理形态学检测,其中甲醇固定的收缩程度最小。
2、固定标本直接提取RNA结果,(1)RNA完整性:与立即冰冻或新鲜组织比较,100%甲醇固定24h,RNA完整性损伤不明显;75%乙醇、100%丙酮固定12h后RNA开始出现损伤带,24h出现明显的损伤;而10%福尔马林、4%PFA固定6h就开始出现明显的损伤,固定24 h几乎很难看清RNA条带。
(2)RNA得率析因分析结果显示,不同固定剂、固定时间、固定温度下固定的组织中所提RNA的得率有显著性差异(P<0.01),沉淀类固定剂固定后组织RNA得率明显高于醛类固定剂(P<0.01);三种沉淀类固定剂之间差别无统计学意义伊>0.01);4%PFA高于10%福尔马林(P<0.01)。固定剂、固定时间和固定温度之间有显著性交互作用(P<0.01),4℃甲醇固定6h的RNA得率最高,10%福尔马林在室温下固定48h得率最低。
参考文献
[1]Rapid differentiation between Hantaan and Seoul viruses by polymerase chain reaction and restriction enzyme analysis.Kim EC,Kim IS,Choi Y,et al.Journal of Medical Virology.1994
[2]Detection of HCV-RNA in paraffin-embedded liver biopsies from patients with autoimmune hepatitis.Savage K,Dhillon AP,Schmilovitz-Weiss H,et al.Journal of Hepatology.1995
[3]Epstein-Barr virus and human hepatocellular carcinoma.Shamim A,Huifeng L,Ramesh P,et al.Cancer Letters.2003
[4]Epstein-Barr virus and human hepatocellular carcinoma.Akhter S,Liu H,Prabhu R,et al.Cancer Letters.2003
[5]Relman.Detection and Identification of Previously Unrecognized Microbial Pathogens.David A.Emerging Infections.1998
[6]Relman.Detection and Identification of Previously Unrecognized Microbial Pathogens.David A.Emerging Infections.1998
[7]Differentiation between porcine epidemic diarrhea virus and transmissible gastroenreritis virus in formalin-fixed paraffin-embedded tissues by multiplex RT-nested PCR and comparison with in situ hybridization.Jung K,Kim J,Kim O,et al.Journal of Virology.2003
[8]贺莉萍.RNA病毒感染组织标本保存方法探讨[D].武汉大学,2004.
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