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抗人SUMO3抗体的制备方法

发布日期:2020/2/1 11:46:39

背景及概述[1]

SUMO蛋白分布广泛。人类基因组主要编码4种SUMO蛋白亚型SUMO1、SUMO2、SUMO3和SUMO4。其中,SUMO1~3起主要作用并在各种组织中均有表达,而SUMO4主要在肾、脾和淋巴结中表达。在各亚型中,SUMO1和SUMO2具有50%的序列同源性,SUMO2和SUMO3高度相似,仅有3个氨基酸差异,同源性高达95%,所以经常共写为SUMO2/3。在针对3种SUMO蛋白亚型的实验组中,发现抗SUMO2抗体和抗SUMO3抗体在PBC和其他自身免疫性疾病两组间的阳性率差异P值接近,表明SUMO2和SUMO3二者同源性高。鉴于成熟SUMO2和SUMO3蛋白之间的高度同源性,推测识别抗SUMO2抗体的疾也可能同时识别抗人SUMO3抗体,这有待后续实验进一步考证。抗人SUMO3抗体针对源自人SUMO-3蛋白的C末端区域的合成肽产生。与人SUMO3蛋白反应,也称为SMT3A,SMT3h1或Sentrin3。在WesternBlots上,它识别出一个约18kD的单个波段。在~25kD,~35kD及以上可观察到几个未知来源的条带。已经用SK-OV3人卵巢腺癌或Jurkat人T淋巴细胞白血病细胞裂解物证实了反应性。

制备[1]

抗人SUMO3抗体制备如下:

1)引物的设计与合成 

利用NCBI找到SUMO3 蛋白的编码序列,设计引物对目的片段进行PCR扩增。SUMO3蛋白上游引物FP:TTA AGA AGG AGA TAT ACC ATG TCCGAG GAG AAG CCC AAA GAG,下游引物RP:GTG GTG GTG GTG GTG CTC GAG GAA ACTGTG CCC TGC CAA GCT。

2)人SUMO3基因原核表达载体的构建 

利用聚合酶链式反应(PCR)扩增3种目的蛋白的DNA片段。PCR反应体系为:95℃,预变性3miN,95℃变性30s、60℃复性30s、72℃延伸35s、30个循环后72℃5miN终止反应。选择已构建好的含His标签序列的pET-28A质粒,根据多克隆位点以NCOI和XHOI作为酶切位点,对该质粒进行双酶切。将扩增的PCR产物和酶切后的质粒混合,导入GB05-DiR大肠杆菌培养。通过卡纳抗性筛选阳性单克隆,经PCR进行菌落扩增。采用成品试剂盒对过夜培养的菌种提取含目的DNA片段的重组质粒,采用紫外分光光度计测试其浓度。

3)人SUMO3蛋白在大肠杆菌中的诱导表达 

将测序正确的人SUMO3重组质粒转化至BL21-DE3,选取阳性单克隆于液体培养基37℃振荡培养至OD值约为0.6。在诱导剂IPTG(1M/L)的条件下分别于37℃摇床培养4H和25℃摇床过夜。收获不同条件下的菌液,SDS-PAGE电泳检测。最终确定菌种的最适诱导表达条件为37℃摇床培养4H。

4)人SUMO3蛋白表达产物分离与纯化 

将置于-80℃冰箱保存的菌体取出,用20Ml 5mm咪唑(作为裂解缓冲液)(Lysis Buffer)重悬。期间按1∶500添加PMSF以防止蛋白降解。再按1∶100添加溶菌酶(1M/L),之后每隔5min涡旋振荡1次,冰上孵育30min。超声破菌,功率36%,每次工作2s,间歇3s,待上清液澄清可透光提示破菌完成。采用亲和层析柱和超滤管进行蛋白的纯化。为防止蛋白降解,在超滤之后需将目的蛋白分装到若干个EP管中,做冷干,制成蛋白干粉并置于-80℃超低温冰箱长久保存。

主要参考资料

[1] 抗SUMO抗体在原发性胆汁性胆管炎临床诊疗中的价值

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