拟枝孢镰刀菌PCR试剂盒的应用
发布日期:2023/12/28 9:03:13
背景[1-3]
拟枝孢镰刀菌PCR试剂盒是一种用于检测拟枝孢镰刀菌的PCR试剂盒。拟枝孢镰刀菌是一种常见的真菌,可以引起多种感染,包括皮肤感染、呼吸道感染和血液感染等。该试剂盒包含PCR反应体系和引物,可以扩增拟枝孢镰刀菌的DNA序列,从而实现对拟枝孢镰刀菌的快速检测和鉴定。
拟枝孢镰刀菌PCR试剂盒通常包括以下组分:
PCR反应缓冲液:用于调节PCR反应体系的pH值和离子强度。
dNTPs:即脱氧核苷酸三磷酸,是PCR反应中必需的原料。
MgCl2:即二氢氧化镁,是PCR反应中必需的离子。
TaqDNA聚合酶:即热稳定DNA聚合酶,可以催化DNA的合成反应。
引物:即特异性DNA序列,可以与目标DNA序列互补结合,引导PCR反应进行。
拟枝孢镰刀菌是一种常见的真菌,可以引起多种农作物和植物的病害。该试剂盒通过特定的PCR引物和探针,能够特异性地检测拟枝孢镰刀菌的DNA,从而实现对拟枝孢镰刀菌的快速、准确检测。
拟枝孢镰刀菌PCR试剂盒
拟枝孢镰刀菌PCR试剂盒的使用通常包括以下步骤:
提取样本中的DNA:使用试剂盒提供的DNA提取试剂,从待检测的样本中提取出DNA。
配置PCR反应液:将试剂盒提供的PCR反应液与提取出的DNA混合,进行PCR反应。
运行PCR反应:将配置好的PCR反应液放入PCR仪中,按照设定的程序进行PCR反应。
检测结果:PCR反应结束后,通过观察产物的大小和数量,判断是否检测到拟枝孢镰刀菌的DNA。
需要注意的是,使用拟枝孢镰刀菌PCR试剂盒时,应遵循试剂盒说明书中的操作规范和安全注意事项。同时,对于疑似拟枝孢镰刀菌感染的样本,应结合临床表现和其他实验室检查结果进行综合判断。
应用[4-5]
拟枝孢镰刀菌PCR试剂盒可以用于沙棘枝枯病病原菌鉴定及检测
从甘肃省庆阳市采集的沙棘枝枯病病株进行病原物的分离鉴定,并对具有强致病性菌株进行生物学特性的研究,选取了10种化学药剂进行了病原菌的室内药剂筛选及盆栽药效测定试验,并制定了该病原菌的荧光定量检测体系,为沙棘枝枯病的识别及防治提供理论依据。
研究结果如下:1.沙棘枝枯病病原菌的分离与鉴定:明确了引起甘肃省庆阳市沙棘枝枯病病原菌种类。实验共采集了120份感病严重的沙棘植株,进行了病原菌的分离鉴定。从中共分离出56株代表菌株,通过致病性的检测得到其中编号为G1-5-1的菌株发病率达100%。对其进行了形态学鉴定及分子鉴定,结果显示该菌大型分生孢子略微弯曲,呈镰刀状,多数有三个隔膜,初步鉴定表明其具有镰刀菌的特性。结合拟枝孢镰刀菌PCR试剂盒分子鉴定方法,对其ITS序列和EF序列所构建的系统发育树进行分析,证明了引起甘肃沙棘枝枯病的致病菌G1-5-1为拟枝孢镰刀菌(Fusarium sporotrichioides)。
2.沙棘枝枯病病原菌生物学特性的研究:分别在不同培养基、不同光照、不同p H值、不同温度及不同碳氮源条件下对沙棘枝枯病致病菌进行培养,测定其菌丝生长及产孢情况。结果表明,病原菌G1-5-1在PDA培养基上菌丝生长速度最快,在PMA培养基上产孢量最大;适宜其生长的温度在15-30℃之间,25℃时菌丝生长速度和产孢量最大;全黑暗条件下更利于菌丝的生长及产孢;p H为5时其菌丝生长速度最快,p H为6时产孢量最大;在以蔗糖为碳源的培养基上菌丝生长速度最快,产孢量最大;在以甘氨酸为氮源的培养基上产孢量最大。
参考文献
[1]Development of a recombinase polymerase based isothermal amplification combined with lateral flow assay(HLB-RPA-LFA)for rapid detection of"Candidatus Liberibacter asiaticus".[J].Ghosh Dilip Kumar;;Kokane Sunil B;;Kokane Amol D;;Warghane Ashish J;;Motghare Manali R;;Bhose Sumit;;Sharma Ashwani Kumar;;Reddy M Krishna.PloS one,2018
[2]Development of a recombinase polymerase amplification combined with lateral-flow dipstick assay for detection of bovine ephemeral fever virus[J].Peili Hou;;Guimin Zhao;;Hongmei Wang;;Chengqiang He;;Yanjun Huan;;Hongbin He.Molecular and Cellular Probes,2018
[3]Sea buckthorn as a source of important bioactive compounds in cardiovascular diseases[J].Beata Olas.Food and Chemical Toxicology,2016
[4]Determination of ribosomal DNA copy number and comparison among strains of Coccidioides.[J].Johnson Suzanne M;;Carlson Erin L;;Pappagianis Demosthenes.Mycopathologia,2015
[5]陈悦.沙棘枝枯病病原菌鉴定及检测[D].沈阳农业大学,2021.
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