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羊痘病毒PCR试剂盒的应用

发布日期:2023/12/28 8:50:02

背景[1-3]

羊痘病毒PCR试剂盒是一种用于检测羊痘病毒的试剂盒。该试剂盒利用PCR技术,通过特定的引物和探针,对羊痘病毒的DNA进行扩增,从而实现对羊痘病毒的快速、准确检测。

羊痘病毒是一种引起羊痘病的病原微生物,具有较高的传染性和致病性。羊痘病毒PCR试剂盒可以用于检测疑似感染羊痘病毒的动物样本,如羊的皮肤病变组织、血液等。通过检测羊痘病毒的DNA,可以确定感染源,为防控和治疗羊痘病提供科学依据。

羊痘病毒是一种引起羊痘的病毒,可以感染人类和其他动物。该试剂盒包含PCR反应体系和引物,可以扩增羊痘病毒的DNA序列,从而实现对羊痘病毒的快速检测和鉴定。

羊痘病毒PCR试剂盒通常包括以下组分:

PCR反应缓冲液:用于调节PCR反应体系的pH值和离子强度。

dNTPs:即脱氧核苷酸三磷酸,是PCR反应中必需的原料。

MgCl2:即二氢氧化镁,是PCR反应中必需的离子。

TaqDNA聚合酶:即热稳定DNA聚合酶,可以催化DNA的合成反应。

引物:即特异性DNA序列,可以与目标DNA序列互补结合,引导PCR反应进行。

羊痘病毒PCR试剂盒.png

羊痘病毒PCR试剂盒

羊痘病毒PCR试剂盒的操作步骤如下:

1.样本采集:从患者体内采集血液、粪便、组织等样本,并将其保存在无菌容器中。

2.DNA提取:将采集到的样本进行DNA提取,通常采用柱式或磁珠式DNA提取试剂盒。提取后的DNA应保存在-20°C或更低的温度下。

3.PCR反应体系准备:根据羊痘病毒PCR试剂盒说明书的要求,配制PCR反应体系,包括引物、荧光探针、dNTPs、DNA聚合酶等。

4.PCR反应:将提取的DNA加入到PCR反应体系中,进行PCR反应。反应条件和时间根据试剂盒说明书的要求进行设置。

5.结果分析:将PCR反应后的产物进行荧光信号检测,根据荧光信号的出现情况判断是否存在羊痘病毒的感染。

应用[4-5]

羊痘病毒PCR试剂盒可以用于绵羊痘病毒和山羊痘病毒双重PCR检测方法的建立

研究从分子生物学出发,以羊痘病毒PCR试剂盒PCR方法为技术基础,建立了一种鉴别别诊断SPPV和GTPV的双重PCR检测方法,主要研究内容包括以下几个方面:

1、通过对GenBank中发表的SPPV和GTPV的全基因组序列进行分析,应用Primer Premier5.0生物学软件设计出两对引物进行PCR反应,将扩增的PCR产物进行纯化后连接到pMD19-T载体,构建质粒pMD19-S和pMD19-G,质粒测序结果与GenBank中发表的基因组序列进行比对,结果表明,两对引物能特异性地扩增出木的片段,pMD19-S与SPPV基因组序列的相似性在98%以上,pMD19-G与GTPV基因组序列的相似性为96%。

2、通过对羊痘病毒PCR试剂盒PCR反应体系中引物浓度、Taq DNA聚合酶浓度和退火温度的优化,建立了SPPV单重PCR检测方法和GTPV单重PCR检测方法。特异性试验结果表明:各单重PCR方法仅对目的基因有扩增,对其他病原或健康组织无扩增。灵敏度试验结果表明:SPPV单重PCR检测方法最低可检测到3.45×106copies/μL的SPPV质粒DNA,GTPV单重PCR检测方法最低可检测到3.42×l05copies/μL的GTPV质粒DNA。

3、在已建立的SPPV单重PCR方法和GTPV单重PCR方法的基础上,通过对羊痘病毒PCR试剂盒PCR反应体系中引物浓度、dNTP浓度,Mg2+浓度和退火温度进行优化,建立了单管同时扩增SPPV和GTPV的双重PCR方法。特异性试验结果表明:该方法能特异性扩增SPPV长度为177bp和GTPV长度为222bp的目的片段,对其他病原或健康组织无扩增。灵敏度试验结果表明:该方法最低可检测到1.725×107copies/μL的SPPV质粒DNA和1.71×106copies/μL的GTPV质粒DNA。

4、分别采用病毒分离、绵羊痘和山羊痘单重PCR和双重PCR方法对采自甘肃与重庆地区的50份疑似羊痘病料进行检测,其阳性检出率分别为14%、4%、10%、14%。试验表明:双重PCR能区别诊断绵羊痘和山羊痘,具有更高的特异性,优于病毒分离培养方法;单重羊痘病毒PCR试剂盒PCR方法与双重羊痘病毒PCR试剂盒PCR的符合率为100%,单重的PCR可以用于对双重PCR扩增结果的验证。双重PCR方法简便、快速、具有高灵敏度和特异性,可以用于临床样品的检测。

参考文献

[1]Phylogenetic analysis of Chinese sheeppox and goatpox virus isolates[J].Zhou Tao;;Jia Huaijie;;Chen Guohua;;He Xiaobing;;Fang Yongxiang;;Wang Xiaoxia;;Guan Qisai;;Zeng Shuang;;Cui Qing;;Jing Zhizhong.Virology Journal,2012

[2]Real time PCR method for simultaneous detection,quantitation and differentiation of capripoxviruses[J].Charles Euloge Lamien;;Mamadou Lelenta;;Wilfried Goger;;Roland Silber;;Eeva Tuppurainen;;Mirta Matijevic;;Antony George Luckins;;Adama Diallo.Journal of Virological Methods,2010(1)

[3]Yemen and Vietnam capripoxviruses demonstrate a distinct host preference for goats compared with sheep.[J].Babiuk Shawn;;Bowden Timothy R;;Parkyn Geoff;;Dalman Brett;;Hoa Dong Manh;;Long Ngo Thanh;;Vu Pham Phong;;Bieu Do Xuan;;Copps John;;Boyle David B.The Journal of general virology,2009

[4]The use of lumpy skin disease virus genome termini for detection and phylogenetic analysis[J].Yehuda Stram;;Larisa Kuznetzova;;Orly Friedgut;;Boris Gelman;;Hagai Yadin;;Marisol Rubinstein-Guini.Journal of Virological Methods,2008(2)

[5]肖雯.绵羊痘病毒和山羊痘病毒双重PCR检测方法的建立[D].西南大学,2013.

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