蛋白酶K缓冲液(10×)的应用
发布日期:2023/10/9 14:21:24
背景[1-3]
蛋白酶K缓冲液(10×)由Tris-HCl缓冲液(pH8.3)、氯化钾、氯化镁等组成,蛋白酶K反应时使用该反应缓冲液,工作浓度为1×。
蛋白酶K缓冲液(10×)是一种用于蛋白酶K反应的缓冲液。它由Tris-HCl缓冲液(pH8.3)、氯化钾、氯化镁等组成。该缓冲液的工作浓度为1×,需要在室温下保存,有效期为12个月。
蛋白酶K是一种广泛应用于分子生物学和蛋白质组学研究中的蛋白水解酶,能够特异性地切割赖氨酸残基侧的肽键。蛋白酶K缓冲液能够为蛋白酶K提供适宜的反应环境,保证蛋白酶K的活性和稳定性,从而提高实验的可靠性和准确性。
蛋白酶K缓冲液(10×)
蛋白酶K缓冲液(10×)是一种用于蛋白质消化的缓冲液,主要成分包括:
1.10 mM Tris-HCl(三羟甲基氨基甲烷):一种常用的pH值调节剂,用于维持缓冲液的pH值。
2.150 mM NaCl(氯化钠):用于维持缓冲液的离子强度和渗透压。
3.0.5%Nonidet P-40(NP-40):一种表面活性剂,可以增加缓冲液的溶解性,有助于蛋白质分子的分散和溶解。
这种缓冲液通常用于Western blotting实验中,用于将蛋白质从凝胶中转移到膜上,以便进行后续的检测和分析。在Western blotting实验中,蛋白质样品首先被电泳分离到凝胶上,然后使用蛋白酶K消化掉非特异性结合的蛋白质,使得只有目标蛋白质能够与抗体结合。最后,将膜上的蛋白质转移到含有目标蛋白的溶液中,进行后续的分析。
应用[4][5]
蛋白酶K缓冲液(10×)可以用于密码子优化的蛋白酶K在毕赤酵母中的表达及分离纯化
蛋白酶K是由林伯氏白色念球菌(Tritirachium album Limber)分泌的一种重要的丝氨酸蛋白酶,具有较高的蛋白水解活性。蛋白酶K多用于一些生化实验中,如在核酸提取中,可以除去核酸中的DNA酶和RNA酶;在原位杂交中,蛋白酶K具有降解包围靶DNA蛋白质的作用,可以用来处理杂交前的样本,提高检测的敏感性。现在商业化供应的蛋白酶K主要由林伯氏白色念球菌分泌获得。林伯氏白色念球菌生长缓慢,难以高密度培养,蛋白酶K的产量较低。另外,林伯氏白色念球菌还会分泌其他的蛋白酶,增加了下游分离纯化的难度。
本实验利用毕赤酵母表达系统,实现了蛋白酶K的分泌表达,省去了细胞破碎,DNA沉淀等步骤,提高了产物的回收率。为了提高蛋白酶K的表达量及简化分离纯化工艺,本实验对蛋白酶K密码子进行了优化,将蛋白酶K的密码子都变成了毕赤酵母偏爱的密码子,并在目的基因3’端加上六个组氨酸标签,然后利用人工合成的方法获得目的基因。
实验构建了蛋白酶K酵母表达载体,将其导入毕赤酵母GS115中实现了分泌表达,分泌的蛋白酶K可以利用Ni-NTA亲和层析柱进行分离纯化,减少了分离纯化步骤,提高了蛋白酶K的收率。由于发酵条件对产物的表达量有很大影响,实验对诱导温度、pH、诱导剂浓度及诱导时间等条件进行了优化,确定发酵条件。利用优化的条件进行5L发酵罐发酵,并通过测定了菌体生长曲线来确定开始诱导时间。在下游分离纯化中,利用三种方法进行纯化,通过比较这三种纯化方法的酶收率及比活,确定的纯化方法。
结果表明,pPIC9K-proteinase K表达载体构建正确,并实现了在毕赤酵母中的分泌表达。通过摇瓶发酵确定的发酵条件为甲醇量0.75%,温度25℃,pH7.0,诱导时间为144h。利用优化的条件进行5L发酵罐发酵,蛋白酶K表达量可以达到2.2g/L,比目前现有蛋白酶K工业生产方法的产率(0.3-0.5g/L发酵液)高4-7倍。
最后,通过比较三种纯化方法的酶收率及比活,可以看出,将去菌体后的发酵液直接通过Ni-NTA亲和层析柱层析可以得到较好的纯化效果,无需对去菌体后的发酵液进行前期处理,回收率可以达到84%,酶的比活为175U/mg。
参考文献
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[2]Somatic mitochondrial DNA mutations in early parkinson and incidental lewy body disease.Michael T.Lin;;Ippolita Cantuti‐Castelvetri;;Kangni Zheng;;Katie E.Jackson;;Yong B.Tan;;Thomas Arzberger;;Andrew J.Lees;;Rebecca A.Betensky;;M.Flint Beal;;David K.Simon.Ann Neurol.,2012
[3]Codon optimization through a two-step gene synthesis leads to a high-level expression of Aspergillus niger lip 2 gene in Pichia pastoris.Jiangke Yang;;Liying Liu.Journal of Molecular Catalysis.B,Enzymatic,2010
[4]Insights derived from molecular dynamics simulation into the molecular motions of serine protease proteinase K.Shu-Qun Liu;;Zhao-Hui Meng;;Yun-Xin Fu;;Ke-Qin Zhang.Journal of Molecular Modeling,2010
[5]孙风敏.密码子优化的蛋白酶K在毕赤酵母中的表达及分离纯化[D].大连理工大学,2015.
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