关于感受态细胞,你不可不知的那些事儿~
发布日期:2020/1/8 8:29:48
01
为什么DH5α生长速度慢/长斑小?
原因:
(1)DH5α感受态细胞生长速度较慢;
(2)涂板菌液太多,菌落过多,导致菌落生长速度慢/菌落小。
方案:
(1)延长菌的生长时间;
(2)建议减少菌液涂布量,剩下的菌液可放4℃保存,看菌的生长状况再决定去留。
02
DH5α和DH5α-的区别是什么?
DH5α需要IPTG和X-Gal共同使用进行蓝白斑筛选。
DH5α-无需加入IPTG,只需X-Gal即可进行蓝白斑筛选。
03
Mach1T1和Turbo哪个生长速度快?
Turbo
04
细菌怎么实现抗噬菌体的特点?
(1)抑制吸附:改变细菌表面的受体蛋白结构,受体缺失,竞争性抑制产物的作用等;
(2)阻止噬菌体DNA的注入;
(3)降解或干扰噬菌体DNA;
(4)流产感染。
05
DB3.1细胞是怎样实现含有ccdB自杀基因在细胞内扩增的?
ccdB蛋白的毒性作用是通过与促旋酶GyrA亚基第462位氨基酸相结合使得DNA断裂后不能进行修复,DNA合成受阻,导致细胞死亡。
DB3.1菌株的细胞含有gyrA462基因,能够表达GyrA亚基蛋白与ccdB结合的区域,可以竞争性抑制ccdB蛋白的活性,使得促旋酶可以正常行使功能,实现含有ccdB的载体的正常扩增。
06
从JM110细胞制备的质粒可以用于基于Dpn I消化的点突变试剂盒吗?
不能。JM110是甲基化基因dam,dcm缺失突变株,在其内扩增的质粒无法进行甲基化,而点突变试剂盒中的DpnⅠ的作用是消化甲基化的模板质粒。
注:
(1)基于DpnⅠ消化的点突试剂盒是以甲基化的载体质粒作为模板,设计一对点突引物进行扩增;
(2)使用DpnⅠ消化甲基化的模板质粒;
(3)PCR扩增的片段没有甲基化,因此不能被DpnⅠ消化降解;
(4)将DpnⅠ消化后的产物转入感受态细胞。
07
大肠杆菌质粒甲基化有哪几类?通过何种方法可以去甲基化?何种方法来验证质粒已经去甲基化?JM110可以用于大量质粒制备吗?
2种,Dam,Dcm(Dam甲基化酶可将GATC序列中的腺嘌呤N6位点进行甲基化修饰,Dcm甲基化酶可将CCAGG和CCTGG序列中胞嘧啶C5位点进行甲基化修饰)。
可以将质粒转化进入JM110感受态细胞中,实现质粒的去甲基化。
可以使用XbaⅠ酶切的方法验证质粒是否去甲基化。
不可以,JM110感受态细胞转化效率低,并且它不能使质粒甲基化,容易引起突变。
08
stbl3和stbl4的区别(菌株是从哪家公司来的)?适用于哪种类型的质粒构建?
区别:(Stbl3和Stbl4菌株是从invitrogen公司来的)Stbl3为链霉素抗性菌株,Stbl4是四环素抗性菌株。Stbl4较Stbl3生长较慢。
适用于逆转录病毒或慢病毒质粒的构建,即带有5’-LTR和3’-LTR结构的质粒,如pLV-Flag质粒。
09
蓝白斑筛选原理是什么?
(1)蓝白斑筛选的条件是具有LacZα编码区的载体与可以进行α-互补的宿主细胞(如Mach1-T1、TOP10、DH5α、JM109、DH10B和NEB10-beta等)配合使用;
(2)一些载体具有LacZα基因编码区,可以编码LacZ蛋白N端的α片段(此编码区中含有多克隆位点,允许外源基因的插入)。其宿主细胞是一种仅可以编码LacZ蛋白C端ω区域的细胞,载体和宿主单独产生的LacZ片段并没有β-半乳糖苷酶活性;
(3)当载体进入宿主细胞时,载体的α片段和宿主的ω片段实现了互补,由α-互补产生的β-半乳糖苷酶具有活性,在IPTG和X-Gal的存在下,菌落变为蓝色;
(4)但是当外源基因插入到在载体LacZα编码区中,破坏了LacZ基因α片段的正常表达,使得其与宿主细胞不能进行α-互补,因此在IPTG和X-Gal的存在下,菌落为白色。
10
DH10B和DH10Bac有何区别?
DH10B是一种可以用来进行大质粒(>8 kb)转化的克隆感受态细胞。
DH10Bac是一种用于昆虫杆状病毒Bac-to-Bac系统中同源重组所用的菌株,其可用于pFastBac系列质粒(如pFastBacl和pFastBacDual)的转化。其感受态细胞中含有用于pFastBac系列质粒重组的Bacmid和辅助质粒。
11
BL21 和BL21(DE3)的区别是什么,DE3代表什么基因?
BL21(DE3)是在BL21菌株的基因组上整合了T7 RNA聚合酶基因,适合于T7系统的表达(具有T7 promoter)。
DE3是一段可以表达T7 RNA聚合酶的序列,通过溶原性噬菌体将序列整合到细菌基因组中。
12
BL21(DE3)和T7 express表达菌有什么区别?
T7 express表达菌株来源于BL21菌株,T7 express与BL21(DE3)的主要区别在于T7 express菌株的T7 RNA聚合酶基因整合在菌株基因组中的Lac操纵子区域,并具有抗T1噬菌体感染的特点。BL21(DE3)菌株中的T7 RNA聚合酶基因来源于噬菌体溶原方法,存在噬菌体成分。
13
表达含有稀有密码子的基因需要选择哪类感受态细胞,这类细胞实现表达的原理是什么?
Rosetta(DE3)
Rosetta(DE3)具有一个带有氯霉素抗性的质粒,可以补充6种稀有密码子的tRNA(精氨酸 Arg R: AGA AGG,异亮氨酸 Ile I: AUA, 脯氨酸 Pro P CCC, 亮氨酸Leu L:CUA,甘氨酸 Gly G:GGA)。
14
使用BL21(DE3)细胞进行蛋白表达时,细胞一诱导就死,请问用什么方法解决?
可以使用BL21(DE3)pLysS 或T7pLysY表达菌株。
15
pLysY和pLysS有什么区别?
pLysY表达的T7溶菌酶保留了对T7RNA聚合酶的抑制作用,但是缺失了水解细胞壁的酰胺酶活性,避免了诱导过程中细胞的裂解。
pLysS表达的T7溶菌酶具有完整活性。
16
含有二硫键的蛋白请问用何种感受态细胞比较好?
OrigamiB(DE3)或Shuffle T7-K12,Shuffle T7-B。
17
增加表达蛋白的可溶性表达采用何种感受态细胞?
OrigamiB(DE3)或Shuffle T7-K12,Shuffle T7-B。
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使用OrigamiB(DE3)感受态细胞时应该注意什么?
OrigamiB(DE3)感受态细胞具有卡那霉素和四环素抗性,所以转化的质粒不能是卡那霉素抗性或四环素抗性的。
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说明书上写这XL10-Gold细胞具有四环素和氯霉素抗性,我的质粒是氨苄青霉素抗性,请问转化这个质粒时,需要加四环素和氯霉素抗生素吗?
不用,四环素和氯霉素是在菌株的基因组中稳定存在的,不用加这两种抗生素。
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