病毒RNA纯化试剂盒的应用
发布日期:2021/9/6 10:23:40
背景[1-3]
病毒RNA纯化试剂盒采用可以特异性结合病毒RNA的吸附柱和独特的缓冲液系统,适用于从血清、血浆、尿液、脑脊液等无细胞体液及细胞培养上清液中分离病毒RNA。病毒RNA特异性地结合到硅基质膜上,而污染物则流过该膜。通过两次高效洗涤完全去除蛋白质等杂质,然后用无RNase的水或试剂盒提供的RNase-Free Water洗脱高纯度的病毒RNA。由本试剂盒提取的病毒RNA可直接用于RT-PCR、Real-time RT-PCR和印迹分析等实验。
病毒RNA纯化试剂盒
操作步骤:
1、室温下取200μl血清或血浆加到1.5ml离心管(自备)中。
2、向上步溶液中加入20μl蛋白酶K,混匀。
3、加入200μl Buffer GL,涡旋震荡15秒。
4、56℃孵育15分钟,短暂离心,将管壁上的溶液收集到管底。
5、加入250μl无水乙醇,涡旋震荡15秒,室温孵育5分钟,短暂离心,将管壁上的溶液收集到管底。
6、将步骤5得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱中,若一次不能将全部溶液加入吸附柱中,请分两次转入,12000rpm(~~13400×g)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7、向吸附柱中加入500μl Buffer RW1,12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
8、向吸附柱中加入500μl Buffer RW2(使用前检查是否加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
9、向吸附柱中加入500μl无水乙醇,12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
10、12000rpm离心3分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
11、将吸附柱置于一个新的无RNase离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入20-50μl RNase-Free Water,室温放置5分钟,12000rpm离心1分钟,收集RNA溶液,-70℃保存RNA,防止降解。
应用[4][5]
用于动物RNA病毒反向遗传系统的研究和建立研究
SVDV HK/70株生物特性测定、生物信息学分析及以T7 RNAP为基础的体外病毒拯救方法的建立和应用为了建立以T7 RNA聚合酶系统为基础的体外拯救病毒方法,选择猪水泡病病毒(SVDV)HK/70株作为细胞质复制的RNA病毒的研究模型。
首先,分离和鉴定了该病毒,并测定了该病的一些生物学特性。然后构建了SVDV全长cDNA并进行序列测定,以此为基础,分析了其相关生物信息学特征。为了鉴定SVDV HK/70株的全长cDNA分子的感染性,以线化的SVDV HK/70株的全长cDNA质粒(pSVOK12)为模板,应用T7 RNA聚合酶系统在体外进行转录,将获得的RNA用脂质体转染法导入IBRS-2细胞,传代培养,可以观察到典型的SVDV致细胞病变效应。
使用反向血凝鉴定试验、间接免疫荧光实验、RT-PCR和序列测定进行检测,结果表明,从猪水泡病病毒全长cDNA拯救出了猪水泡病病毒(G-SVDV);利用常规负染的方法,电镜观察了G-SVDV的形态;测定了G-SVDV的TCID50和LD50,并与亲本毒进行了比较,结果显示G-SVDV与亲本毒的毒力差别不显著。
参考文献
[1]Rescue of the prototypic Arenavirus LCMV entirely from plasmid[J].Ana B.Sánchez,Juan C.de la Torre.Virology.2006(2)
[2]An efficient helper-virus-free method for rescue of recombinant paramyxoviruses and rhadoviruses from a cell line suitable for vaccine development[J].Susan E.Witko,Cheryl S.Kotash,Rebecca M.Nowak,J.Erik Johnson,Lee Anne C.Boutilier,Krista J.Melville,Sannyu G.Heron,David K.Clarke,Aaron S.Abramovitz,R.Michael Hendry,Mohinder S.Sidhu,Stephen A.Udem,Christopher L.Parks.Journal of Virological Methods.2006(1)
[3]Infective viruses produced from full-length complementary DNA of swine vesicular disease viruses HK/70 strain[J].Haixue Zheng,Xiangtao Liu,Youjun Shang,Jinyan Wu,Xingwen Bai,Ye Jin,Shiqi Sun,Huichen Guo,Hong Tian,Xia Feng,Shuanghui Yin,Jianhong Guo,Guozheng Cong,Zaixin Liu,Huiyun Chang,Junwu Ma,Qingge Xie.Chinese Science Bulletin.2006(17)
[4]The clearance of viruses and transmissible spongiform encephalopathy agents from biologicals[J].Mahmood Farshid,Rolf E Taffs,Dorothy Scott,David M Asher,Kurt Brorson.Current Opinion in Biotechnology.2005(5)
[5]郑海学.动物RNA病毒反向遗传系统的研究和建立[D].中国农业科学院,2007.
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