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DNA修复蛋白GIYD2抗体的应用

发布日期:2020/7/13 15:29:14

背景[1-3]

DNA修复蛋白GIYD2抗体是一类可以特异性结合DNA修复蛋白GIYD2的多克隆抗体,可以用于IHC,WB,IF,IP,ELISA等科研实验。

检测原理:双抗体夹心法测定标本中DNA损伤修复基因GIYD2水平。用纯化的DNA损伤修复基因GIYD2抗体包被微孔板,制成固相抗体,往包被单抗的微孔中依次加入DNA损伤修复基因GIYD2,再与HRP标记的DNA损伤修复基因GIYD2抗体结合,形成抗体-抗原-酶标抗体复合物,经过彻底洗涤后加底物TMB显色。TMB在HRP酶的催化下转化成蓝色,并在酸的作用下转化成最终的黄色。颜色的深浅和样品中的DNA损伤修复基因GIYD2呈正相关。用酶标仪在450nm波长下测定吸光度(OD值),通过标准曲线计算样品中DNA损伤修复基因GIYD2浓度。

DNA修复蛋白GIYD2是基因组稳定性的重要调节剂。DNA修复蛋白GIYD2蛋白是SLX1-SLX4结构特异性核酸内切酶的催化亚基,可分解修复和重组过程中形成的DNA二级结构。由于DNA修复蛋白GIYD2部分基因重复,该基因的两个相同拷贝位于16号染色体的p臂上。功能:SLX1-SLX4结构特异性核酸内切酶的催化亚基,可解决DNA修复和重组过程中产生的DNA二级结构。对分支的DNA底物具有核酸内切酶活性,在双链DNA中引入单链切割DNA与ss-DNA的连接处集合。

应用[4][5]

用于冰岛硫化叶菌Sulfolobus islandicus新型ATPase的结构与功能研究

在硫化叶菌细胞中存在的DNA修复途径包括同源重组修复,核酸切除修复和碱基切除修复。与细菌相比,参与这些修复途径的蛋白也更接近于真核生物。

DNA双链断裂(double-strand breaks,DSBs)是细胞内最严重的DNA损伤形式之一。同源重组修复和非同源末端链接是修复DSBs的两种重要途径。目前,在绝大多数古菌中只发现了同源重组修复途径,对参与该途径的保守蛋白Mrell,Rad50和重组酶RadA(真核生物中为Rad51)都有深入的研究。

除此之外,对古菌中参与同源重组修复的其他蛋白也有较多的报道,包括NurA,HerA,Hjc和Hje等。Hollidayjunction(HJ)是同源重组过程中的标志性中间产物,HJ需要被及时的处理以保证顺利地完成DNA修复和染色体的正常分离。

细胞内处理HJ的方式主要有两种,一种是由HJ解离酶介导的"resolution",典型的HJ解离酶包括RuvC,Hjc,Yenl/GENl和Slxl-Slx4/SLX1-SLX4;另一种是由解旋酶、拓扑异构酶及其他蛋白组成的复合体介导的"dissolution"。在细菌中已经报道参与"resolution"过程的蛋白是RuvAB复合物。到目前为止,在古菌和真核生物中还没有鉴定到经典的类似于RuvAB的蛋白复合物。

参考文献

[1]Major and minor crRNA annealing sites facilitate low stringency DNA protospacer binding prior to Type I-A CRISPR-Cas interference in Sulfolobus[J].Marzieh Mousaei,Ling Deng,Qunxin She,Roger A.Garrett.RNA Biology.2016(11)

[2]Application of CRISPR-Cas system in gene therapy:Pre-clinical progress in animal model[J].Lihong Guan,Yawei Han,Shaoyi Zhu,Juntang Lin.DNA Repair.2016

[3]Recombination,Pairing,and Synapsis of Homologs during Meiosis[J].Denise Zickler,Nancy Kleckner.Cold Spring Harbor Perspectives in Biology.2015(6)

[4]KH–RNA interactions:back in the groove[J].Giuseppe Nicastro,Ian A Taylor,Andres Ramos.Current Opinion in Structural Biology.2015

[5]翟斌元.冰岛硫化叶菌Sulfolobus islandicus新型ATPase的结构与功能研究[D].山东大学,2017.

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