寡核苷酸纯化试剂盒
发布日期:2020/4/22 10:08:31
概述[1]
本试剂盒采用硅基质膜技术,通过快速方便的结合-洗涤-洗脱三步骤从多种酶促反应液中纯化回收核苷酸链和DNA片段。适合于从去磷酸化、限制性内切酶酶切、连接、末端标记等反应产物中回收17-40mers的寡核苷酸片段。纯化过程可去除10bp以下的寡核苷酸、盐及其他杂质。回收纯化的寡核苷酸片段纯度高,完整性好,浓度高,方便后续操作。纯化后DNA可用于芯片分析、放射性和荧光测序、连接和转化、限制性酶酶切、标记、显微注射、PCR、体外转录。
实验前准备 [1]
1.本实验需要无水乙醇,离心管请自备。
2.本试剂盒可无选择性的回收溶液中所有DNA片段段(可去除小于10bp的小片段),回收的最小片段可达17bp,如需选择性回收特定片段,同时去除其他不同大小片段,请选择胶回收试剂盒。
3.使用前请检查Buffer1#是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀现象,可在37℃水浴几分钟,即可恢复澄清。
4.次使用前应按照试剂瓶标签的说明在Buffer3#中加入无水乙醇。
5.回收率与初始DNA量和洗脱体积有关。
6.所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
操作步骤[1]
1.估计DNA反应液的体积,如果回收片段<100bp,加入10倍体积的Buffer1#(如PCR反应体系为50µl,则加入500µlBuffer1#);如果回收片段≥100bp,则只需要加入5倍体积的Buffer1#(如PCR反应体系为50µl,则加入250µlBuffer1#)。
2.柱平衡:向已吸附柱中(吸附柱应预先装入收集管中)加入200μlBuffer2#,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
3.将步骤1中所得溶液加入到已装入收集管的吸附柱中,室温放置2min,12,000rpm离心1min。
注意:吸附柱容积为700µl,若样品体积大于700µl可分批加入。
4.离心后,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:对于含有放射性的样品,离心后,将装有废液的收集管弃掉,将吸附柱放入一新的收集管中。
5.向吸附柱中加入600µlBuffer3#(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:对于含放射性的样品,向吸附柱中加入450µlBuffer3#(请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm离心1min。将废液弃掉,将吸附柱重新放回收集管中,重复操作一次。
6.12,000rpm离心2min,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。为确保下游实验不受残留乙醇的影响,建议将吸附柱开盖,置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的乙醇。
7.将吸附柱放到一个新离心管(自备)中,向吸附膜中间位置悬空滴加100-200µlBuffer4#,室温放置2min,12,000rpm离心1min收集DNA溶液。-20℃保存DNA。
注意事项
1)洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液,应保证其pH值在7.0-8.5范围内(可以用NaOH将水的pH值调到此范围)。
2)为了提高DNA的回收量,可将离心得到的溶液重新加回吸附柱中,重复步骤7。
3)洗脱体积不应小于100μl,体积过少会影响回收效率。
4)如果使用TE洗脱,应考虑其中含有的EDTA是否会影响后续的酶促反应。
5)回收大于10kb的DNA片段时,Buffer4#应在50℃水浴中预热,适当延长吸附和洗脱时间,可增加回收效率。
主要参考资料
[1]寡核苷酸纯化试剂盒产品说明书
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